新疆机场由
新疆机场集团有限责任公司管理运营。目前，新疆机场集团管辖20个在用机场，其中
乌鲁木齐市、喀什、
吐鲁番市为4E级机场，库尔勒、
和田县、克拉玛依为4D级机场，阿克苏、
伊宁市、
库车市、
哈密市、
阿勒泰市、
塔城地区、
博乐市、
喀纳斯湖、那拉提、
富蕴县、且末、
莎车县、
若羌县、图木舒克为4C级机场。新疆已经发展成为全国
民用机场数量最多的省份。
2019年，新疆机场集团完成旅客吞吐量3753.6万人次、货邮吞吐量21.7万吨、飞行起降43.3万架次，同比分别增长12%、13%、12.5%。其中
乌鲁木齐地窝堡国际机场完成旅客吞吐量2396.3万人次，同比增长4.1%；全疆
支线机场完成旅客吞吐量1357.3万人次，同比增长29.5%。喀什国际机场、库尔勒机场年旅客吞吐量突破200万人次，
阿克苏市、
伊宁市、
和田机场年旅客吞吐量均已突破100万人次，相继成为“百万级”中型机场。
截至2019年底，运营新疆机场定期航班的航空公司达到35家。共开通在飞航线264条（夏航季309条），其中国内航线236条、
国际航线23条、货运航线5条。有19个国家、23个国际城市、84个国内城市与
乌鲁木齐地窝堡国际机场通航；国际、国内通航点分别较上年增加3个、10个。
目前已有南航股份新疆分公司、海航股份新疆分公司、
天津航空、
乌鲁木齐航空、
山航、
四川航空股份有限公司六家航空公司先后在乌鲁木齐机场设立
外国基地公司和运行基地。乌鲁木齐机场连续2年获得CAPSE年度航班不正常服务
优秀奖；喀什、
伊宁机场获中国民用机场服务质量评价“优秀机场”荣誉。