孢子印（芽孢 print）或称“孢子纹”，是指菇菌孢子散落而沉积的菌褶或菌管的着生模式，孢子印及其颜色是蕈菌分类依据之一。用于食药用菌生物分类、栽培技术研究。孢子印是一种简便易行的方法，能在缺乏显微镜观察或化学染色的情况下对蘑菇进行初步鉴定。

各种真菌的孢子，在形态、大小、颜色等各方面都有很大差异，是真菌鉴定中的主要特征之一，所以一般均应制作孢子印。孢子印就是把菌褶或菌管上的子实层所产生的担孢子接收在白纸或黑纸上。其制作方法也有几种，其一是将新鲜的子实体用刀片齐菌褶把菌柄切断，然后把菌盖扣在白纸上(有色孢子)或黑纸上(白色孢子)，也可把一半白纸和一半黑纸拼粘成一张纸而将菌盖扣于上面，再用玻璃罩扣上。经过2至4小时，担孢子就散落在纸上，从而得到了1张与菌褶或菌管排列方式相同的孢子印。另一种方法是将用来接收孢子的纸折叠起来，在中央剪出一个适合的圆孔。再把菌柄插入洞内，使菌褶紧贴纸上。然后再将子实体连同纸一起放在盛有半杯水的小杯口上，此法可加速孢子印的接收。

孢子颜色大多可被划分为4至5类：白色，粉色，色，和黑紫色。黑紫色有时被进一步细分为紫色和黑色。也有一些例外，如绿色孢子的大青褶伞（Chlorophyllum molybdites）。由于颜色差异，制作孢子印时，可以将菌盖置于同时具有深色和浅色背景的纸上，便于观察不同颜色的孢子。孢子的颜色有时也能通过菌褶的颜色反映，但并不准确。例如，紫丁香菇（杯伞属 nuda）的紫色菌褶会掩盖住它淡粉色的孢子。

当获得孢子印以后，应及时记录新鲜孢子印的颜色，并将其编上和标本相同的号，一起保存或分别保存，以备鉴定时查用。注意不要用手或其他东西擦摸孢子印，以免破坏。

1. 选取刚长出的新鲜蘑菇。

2. 用解剖刀切去蘑菇的菌柄。

3. 把有菌褶面朝下平放在黑纸上，置于不通风处（以免孢子吹散）。

4. 12小时后移去菌盖，观察黑纸上出现的现象。

历史上曾根据孢子颜色对蘑菇进行分类，如口蘑科（Tricholomataceae）的种类大多具有白色孢子。近来分子学研究表明一些孢子颜色不同的真菌也有较近的亲缘关系，这表明孢子颜色虽然是一个重要的分类特征，但并不是唯一的分类依据。