南那珂郡（みなみなかぐん，Minaminaka gun）是过去位于宫崎县的一个郡，已于2009年3月30日因无管辖町村而废除。废除前，南那珂郡辖有北乡町和南町，总面积为241.66平方千米。最初的辖区包含现在的日南市和串间市全部地区。

南那珂郡成立于1884年，当时宫崎县的那珂郡被分割为南那珂郡和北那珂郡。1889年5月1日，随着町村制度的实施，南那珂郡下设油津町和15个村。随后，多个村陆续升格为町，包括肥村（1900年1月1日）、福岛村（1926年10月1日）、南郷村（1940年12月1日）、细田村（1941年1月1日）和吾田村（1948年5月3日）。

1950年1月1日，油津町、饫肥町、吾田町和东郷村合并创建了日南市，脱离了南那珂郡。

1951年1月1日，福岛町和北方村合并创建了新的福岛町。

1954年11月3日，福岛町与大束村、市木村、本城村、都井村合并创建了串岛市，也脱离了南那珂郡。

1955年2月11日，细田町和鹈村并入日南市。

1956年4月1日，酒谷村并入日南市，原村被废除，辖区分别并入南乡町和日南市。

1959年1月1日，北郷村升格为镇，成为北乡町。

2009年3月30日，北郷町和南郷町与日南市合并为新设置的日南市，同时南那珂郡因无管辖町村而被废除。