高歌:
北京大学生命科学学院生物信息学中心研究员、博士生导师。首批青年拔尖人才,亚太
生物信息学网络(APBioNet)执行理事会委员。主要研究方向有非编码
核糖核酸对
干细胞命运决定过程的调控、
基因组中适应性基因获得/丢失对调控网络演化的影响。
个人简介
北京大学生命科学学院生物信息学中心研究员、博士生导师。入选首批青年拔尖人才,亚太生物信息网络(APBioNet)执行理事会委员。
研究内容
随着以深度测序为代表的高通量
生物技术在生命科学领域的广泛应用,各种生物学
大数据以
指数增长大量涌现。这些数据之中蕴藏着大量的宝藏,即生物学的新规律、新发现。但是,这些海量的、指数增长的、并且高噪声的生物数据也带来了巨大的数据分析技术上的挑战。
课题组以
生物信息学分析技术、方法与平台开发为基础,通过综合运用大数据与统计学习(statistical learning)等计算方法,整合高通量遗传学与功能基因组学数据,探索新表达调控因子的功能与演化及其对生物体新性状和新功能的贡献。
课题组主要研究方向:
2)
基因组中适应性基因获得/丢失对调控网络演化的影响
工作经历
2011 - 至今 , 研究员 ,
北京大学生命科学学院2008 - 2010 , 副研究员 , 北京大学生命科学学院
社会服务工作
APBioNet(Asia Pacific
生物信息学 Network,亚太生物信息学网络) 执行委员会委员暨中国代表
中国人工智能学会生物信息学与人工生命专业委员会委员
中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会(筹)委员暨共同发起人
获奖
入选 首批青年拔尖人才支持计划 , 2012
APBioNet Service Award , 2010
首届绿叶生物医药杰出青年学者奖 , 2010
担任杂志编辑
Editorial board member , Genomics, Proteomics \u0026
生物信息学 , 2012 - 至今
Editorial board member , Hereditas , 2015 - 至今
发表论文
1. Hu B, Jin J, Guo A, Zhang H, Luo J,Gao G.*. 2014. GSDS 2.0: an upgraded gene feature visualization server.Bioinformatics(doi: 10.1093/bioinformatics/btu817)
2. Xiao A, Cheng Z, Kong L, Zhu Z, Lin S,Gao G.*, Zhang B. 2014. CasOT: a genome-wide Cas9/gRNA off-target searching tool.
生物信息学30(8): 1180-1182.
3. Jin J, Zhang H, Kong L,Gao G.*, Luo J. 2014. PlantTFDB 3.0: a portal for the functional and evolutionary study of
植物界 transcription factors.Nucleic Acids Res42(1): D1182-1187.
4. Wang J., Kong L.,Gao G., Luo J. 2013. A brief introduction to web-based genome browsers. BriefBioinform14(2): 131-143.
5. Xiao A., Wu, Y., Yang, Z. Hu, Y., Wang, W., Zhang, Y., Kong, L.,Gao, G., Zhu, Z., Lin, S., Zhang B. 2013. EENdb: a database and knowledge base of ZFNs and TALENs for endonuclease engineering.Nucleic Acids Research41(D1): D415-D422.
6. Kong, L., Wang, J., Zhao, S., Gu, X., Luo, J., andGao, G.* 2012. ABrowse - a customizable next-generation genome browser framework.BMC Bioinformatics13: 2. (Featured as “Highly Accessed”)
7. Wang, J., Kong, L., Zhao, S., Zhang, H., Tang, L., Li, Z., Gu, X., Luo, J., andGao, G.*. 2011. Rice-Map: a new-generation rice genome browser.BMC Genomics 12: 165. (Featured as “Highly Accessed”)
8. Xie, C., Mao, X., Huang, J., Ding, Y., Wu, J., Dong, S., Kong, L.,Gao, G., Li, C.Y., and Wei, L. 2011. KOBAS 2.0: a web server for annotation and identification of enriched pathways and diseases.Nucleic Acids Research 39(Web Server issue): W316-322.
9. Zhang, H., Jin, J., Tang, L., Zhao, Y., Gu, X.,Gao, G.*, and Luo, J. 2010. PlantTFDB 2.0: update and improvement of the comprehensive
植物界 transcription factor database.Nucleic Acids Research39(Database issue): D1114-1117.
10. Zhao, S.Q., Wang, J., Zhang, L., Li, J.T., Gu, X.,Gao, G.*, and Wei, L. 2009. BOAT: Basic Oligonucleotide Alignment Tool.BMC Genomics 10 Suppl 3:
S2