现任政协第十三届广东省委员会常务委员，广州中医药大学研究生导师、
广州中医药大学第一附属医院GCP主任、综合科副主任，广东省中医药学会心血管专业委员会委员、广东省医学会老年医学专业委员会委员、广东省临床药理委员会委员。
学术兼任中国药学会中药临床评价专业委员会主任委员、中国中医GCP联盟主席、
中华中医药学会临床药理分会副主任委员、中华中医药学会中药监管科学研究高端智库副主任委员、世中联名医传承工作委员会副会长、国家药监局药品审评专家和注册核查专家 。
广东省广州中医药大学第一附属医院副院长、教授、
主任医师杨忠奇，抗击疫情工作岗位为国家中医药管理局科研应急研究专项专家组副组长，国家中医药管理局科研应急专项专家组。
2021年2月杨忠奇奉命担任国家药监局核查中心专家组长多次前往
武汉市对化湿败毒方和宣肺败毒方的临床研究数据进行核查。
2018年他担任国家药品监督管理局药审中心专家组长，牵头起草相关技术文件。中药“人用经验”研究成果被上级采纳，《中共中央、国务院关于促进中医药传承创新发展的意见》明确要求“加快构建中医药理论、人用经验和临床试验相结合的中药注册审评证据体系”。国家药监局发布《中药注册分类及申报资料要求》和《中药注册专门规定》。