该剧改编自龙门谅、惠广史所著同名漫画作品，故事设定发生在《
血色星期一》第一季中讲述的病毒战结束两年后。一辆搭载有
核弹的飞机逼近
东京，试图引爆核弹毁灭东京。天才黑客藤丸将再次挺身而出，与恐怖势力展开了精彩的攻防战。
在病毒危机结束后两年，受其影响的藤丸（三浦春马饰）决定再也不碰电脑，可是他还是不能阻止自己和朋友九条音弥（
佐藤健饰）、
高木遥（
川岛海荷饰）被卷入到新的计划当中。载有核弹的飞机正在一点点向东京逼近，而东京的群众却毫不知情，为了避免东京遭受到核弹的重创，藤丸和音弥不得不继续开始奋战。而他们所面对的除了老对手
折原玛雅（
吉濑美智子饰）和
神崎润（
成宫宽贵饰）外，还有许多新人。
与《血色星期一》相比，《血色星期一2》有各种各样更为宏大的场面。除了藤丸和音弥，第一季的几位主要人物恐怖分子折原MAYA，J,以及正义一方的警官
雾岛以及萩原等人悉数登场。除了他们之外，故事还增加更多新的人物，到底谁才是敌人，谁才是朋友，一时雾里看花，难辨真假。 （
搜狐评）
很有趣的是，在《血色星期一2》中，警方多半是无用无能的，而也因此他们不得不向身为高中生甚至小学生的天才主人公们求助，这到底是在凸显主人公的超卓能力还是在黑日本警察。 （网易网评）