微球菌科（学名：Micrococcaceae）为放线菌纲微球菌目的一科细菌，包括革兰氏染色阳性、接触酶阳性、好氧或兼性厌氧的球状细菌。此科的模式属为微球菌属(Micrococcus)，如Micrococcus luteus，这些细菌主要生活在空气和皮肤中。

微球菌科的细菌直径在0.5～3.5微米之间，具有1个以上的细胞分裂面，运动或不运动。无休眠时期；营呼吸或发酵代谢，如作用于葡萄糖则产酸不产气；营养要求多样化，都可在5%氯化钠培养基中生长，有些还能在含10%～15%氯化钠的培养基中生长；脱氧核糖核酸中的G+C摩尔含量为30%～75%。

本科现包括微球菌属、葡萄球菌属和动性球菌属3属。

微球菌属：不运动的专性好氧细菌，仅能以氧化方式从葡萄糖产酸，细胞直径0.5～3.5微米。属内有 3种，多见于土壤和水中，也见于人和动物的皮肤上。为非致病菌。模式种为藤黄八叠球菌。

葡萄球菌属：不运动的兼性厌氧菌，发酵葡萄糖产酸不产气。细胞直径为0.51.5微米。属内有3种，多见于人和动物的皮肤和粘膜，有的是重要的化脓菌。模式种是金黄色葡萄球菌。

动性球菌属：能运动的革兰氏阳性好氧细菌，不从葡萄糖产酸。仅有1种，即柠檬色动性球菌，见于活水中。