直江津站（日语：直江津駅／なおえつえき Naoetsu eki）位于上越市靠海侧，是直江津地区（旧直江津市）的交通中心。该站是越后心动铁道（朱鹭铁）及东日本旅客铁道（JR东日本）辖下的铁路车站，2015年3月14日前为JR东日本及西日本旅客铁道的公司分界站。如今由JR东日本新潟支社管理月台、站房等各种车站业务。北陆本线下行的站内号志机为JR东日本与朱鹭铁的实际分界处。

拥有岛式月台3面6线的车站。车站和自由通路的设计是以客船“飞鸟”（飞鸟）为主题。设有绿窗口（营业时间 5：30 - 22：30），亦有配置职员。于三个通路方向皆设有自动剪票闸门，2017年4月起于部分闸机加设对应Suica及其他IC卡的感应器。尽管JR西日本有列车停靠于此，不过车站只有北侧出入口挂有JR东日本的形象标志。售票机对邻近区域车站的车票亦未区别JR东日本或是西日本旅客铁道。以上原因，使得往北陆本线的列车发车时，车掌广播通常不强调“JR西日本”，而改以“JR线”代替。在2015年3月14日后随车站管理权交移后，车站外墙亦移除了JR东日本的商标，只剩下标示日语与英文站名。除此之外，亦设有自动售票机2台、指定席券售票机2台、商店（NEWDAYSmini）、候车室、投币式置物箱与厕所等。

1886年（明治19年）8月15日 - 国有铁路信越本线 关山 - 直江津间通车时设立。

1898年（明治31年） - 移转至现址。

1899年（明治32年）9月5日 - 北越铁道直通列车至本站。

1907年（明治40年）8月1日 - 北越铁道国有化。

1911年（明治44年）7月1日 - 北陆本线 名立 - 直江津间通车。

1930年（昭和5年）4月1日 - 信越本线货物支线 直江津区 - 直江津港间通车。

1940年（昭和15年） - 改建站房为具有三角屋顶的山屋风格。

1945年（昭和20年）12月9日 - 发生三名朝鲜侨民在车站持水管及圆锹攻击乘车旅客的事件，此事件催生出铁道公安职员的制度。

1959年（昭和34年）9月1日 - 废止信越本线货物支线 直江津 - 直江津港间业务。

1985年（昭和60年）3月5日 - 废止专用线随车货物的业务。黑井站南仍保留三菱化学直江津事业所的专用线，提供输送货物的业务。

1987年（昭和62年）3月31日 - 再次开办货物运送的业务。但是考虑到未来将准备修建新的设施，故尚未提供货物列车的停靠。

1987年（昭和62年）4月1日 - 国铁分割民营化后成为JR东日本、西日本旅客铁道的分界站，亦是JR货物辖下的车站。旅客业务由JR东日本办理。

1997年（平成9年）3月22日 - 北越急行通车，部分列车开始直通至本站。

2000年（平成12年）4月7日 - 完成如今车站的站房，并启用自由通路。

2005年（平成15年）12月1日 - 引入自动剪票闸门。

2006年（平成18年）4月1日 - 废止临时随车货物的业务。

2015年3月14日 - JR西日本北陆本线直江津～市振、JR东日本信越本线直江津～妙高高原转由越后心动铁道营运，JR西日本退出直江津站。