曼努埃尔二世（全名曼努埃尔·玛利亚·菲利佩·卡洛斯·阿美利奥·路易斯·米格尔·拉菲尔·加布里埃尔·贡扎加·法兰西斯科·德·阿西西·欧仁尼奥，葡萄牙语：Manuel Maria Filipe Carlos Amélio Luís Miguel Rafael Gabriel Gonzaga Francisco de Assis Eugénio；1889年11月15日—1932年7月2日），是葡萄牙王国末代国王（1908年—1910年在位），葡萄牙国王卡洛斯一世的次子。1908年卡洛斯一世与葡萄牙王储、曼纽的哥哥路易斯·费利佩被激进的共和派刺杀身亡，曼努埃尔二世即位为葡萄牙国王。曼努埃尔二世在1909年被英国国王爱德华七世授予嘉德勋章。

曼努埃尔二世即位后，极力寻求保存布拉干萨王朝对葡萄牙王国脆弱的统治，于是在即位当年遣散了独裁官若昂·佛朗哥和他领导的整个内阁，邀请海军上将阿马拉尔组阁，并邀请复兴党、进步党参加。在他统治的两年时间，七次改组内阁，政局一片混乱，终于在1910年10月3日晚爆发了革命，曼努埃尔二世的宫殿被轰击，他于10月5日被废黜并于当天逃亡到英国海外领地直布罗陀。曼努埃尔二世后定居英国伦敦。

1913年9月4日，曼努埃尔二世与霍亨索伦公主霍亨索伦-西格马林根的奥古斯塔·维多利亚结婚，但没有子嗣。

曼努埃尔二世是一位藏书家，并写了一本中世纪和文艺复兴时期葡萄牙文学指南。

曼努埃尔二世于1932年7月2日逝世于英国托维肯汉姆。由于他没有子嗣，他认可布拉干萨公爵杜阿尔特·努诺为他的继承人。