《环境工程微生物学实验》主要包括三个方面内容：环境工程微生物学实验基础知识、环境工程微生物学基础实验操作、环境工程微生物学综合实验。结合环境工程专业自身特点，《环境工程微生物学实验》力图实现学生在了解、掌握部分常用微生物实验基本操作的基础上，重点通过相关综合设计实验来达到提高实际操作能力的目的。同时，书中补充了大量实际操作图例，使得相关内容更易被理解、消化掌握，增加了《环境工程微生物学实验》的可读性和实用性。
环境工程微生物学作为一门边缘学科，是运用环境工程的手段和方法来加速和强化自然界中污染物的循环、转化和降解，以充分发挥微生物降解、转化污染物的巨大潜力，实现环境工程的高效、稳定和资源的再生利用，消除人类活动对环境所造成污染的一门学科。它在改善人类的生存环境和消除环境污染中起到重要的作用。该课程要求学生要将理论与工程实践紧密结合，是一门实践性很强的课程。因此，大量的课程实验成为巩固和加深学生对基本知识和基本技能掌握与理解的必然要求。
环境工程微生物学实验是环境工程、
环境科学、环境监测等专业本科生的专业基础实验课。掌握必要的环境工程微生物学实验技能对于理解和认识环境工程微生物学的相关理论，从事环境工程的研究工作具有重要的意义。
鉴于目前有关环境工程微生物学课程的专用实验教材较少，而微生物技术在环境工程领域的地位又日益突出，编者在环境工程微生物日常本科实验教学及总结前人经验基础上完成了对本教材的编写。本教材主要分为环境工程微生物学实验基础知识、基础操作实验和综合实验三个部分，其中基础操作实验与综合实验为实验部分，共包括26个实验。