南林中学始名“山县第四中学”，1958年秋创办于徐姓“六甲祠”。校长陈树德，书记徐世杰，教职工13人，3个教学班，163个学生。师生教学于“六甲祠”中堂，住宿于厢房、戏楼。同年秋，由教育局投资兴建了二幢土木结构教学楼，一幢教工宿舍楼，校舍覆盖面积为1800㎡。属县五所重点中学之一。

1964年秋，南林中学更改为耕读中学，增设高中班2个，全校共有教学班6个，学生300余人，成为通山西片规模最大的学校。同年陈树德调离南林中学，王家诠接任校长。

1965年，学校建立了实验室，设备齐全，堪称全县一流，受到教育表彰。1966年“文化大革命”爆发，正常教学秩序被打乱，干部、教师、学生经受了磨炼。

1973年6月王家诠调离南林中学，黄文坚接任校长。

1974年秋，南林中学又改为普通中学，时有12个教学班，其中初一中8个教学班，高中4个教学班，学生600余人，教工42人，成为完全中学，也是县重点中学。学校虽然改为变通中学，但学生仍处于半工半读状态，老师带领学生挖荒山、造梯田，支援农业生产花费了大量的时间。1976年9月，南林中学在文化尖煤矿创办了一所农业大学，朱辉旺任校长，王光宙、刘早福任教员，同年12月撤除。

1980年7月黄文坚调离南林中学。

1980年7月至1984年8月，先后有程觉生、乐建中、徐昌明等人在南林中学担任过校长。

1984年8月，根据教育局有关精神，实行校长选举制，教师聘任制，汪中苏当选为校长，翌年12月汪中苏调离南林中学。

1984年南林中学再次改为农职业中学，时有高中班4个，学生151人，初中班8个，学生566人，教职工48人。

1986年元月徐明华担任校长，同年6月徐明华调任教育组副组长，余子炎接任中学校长，翌年7月余子炎调离，徐明华再度担任校长。

1987年9月南林中学分为职业高中和普通初中，徐志松任职业高中校长，徐明华任初中校长。1991年7月职业高中停办。

1991年拆除了50年代兴建的土木结构教学楼，由镇政府集资建造了幢钢筋水泥结构教学楼，共三层，总面积为2348㎡。同年南林中学中考成绩名列全县乡镇中学第一，有三人考取鄂南高级中学，教委副主任杨明荣亲临学校祝贺。

1996年9月徐明华调任教育组组长，孙利军接任校长。

1997年拆除土木结构厨房，建造了钢筋水泥结构厨房，建筑面积为570㎡。

1998年11月孙利军调离南林中学，陈崇武任负责人。

1999年由教育局投资建造了一栋女生宿舍楼，共四层，总面积为1200㎡。同年由镇政府集资，改建了一栋综合大楼，共三层，总面积为1518㎡。在该楼设立了办公室、仪器室、档案室、化学实验室、物理实验室、会议室、教工健身房。

2000年2月，陈崇武调离南林中学，金国雄任校长。

2001年、2002年中考成绩分别获得全县乡镇中学第二名、第一名，并有7人考取鄂南高级中学。

2003年3月金国雄调任厦铺教育组组长，陈时顺接任校长。

2004年由教育局投资建造了总面积为1100㎡的男生宿舍楼和总面积为360㎡的餐厅。翌年学校投资20万元购置了一套现代化厨房设备，结束了学生个体蒸饭菜的历史。

2004年、2005年根据国家有关减免贫困生学杂费的政策，共计减免了72380元学杂费。2006年减免了所有学生学杂费。

2006年校刊《南风》正式发行。

2006年中考成绩又居全县乡镇学校榜首，并有四个考取鄂高，其中有二人进入鄂高理科实验班。同年，夏显、夏乔波、孙洪峰在数学竞赛中分别获得国家级一、二、三等奖，徐志俊、夏波、夏显在英语竞赛中获国家级二等奖。

2006年徐德木老师写作的论文获省级二等奖，陈时顺、徐虎城老师的论文获省级三等奖，徐明老师的《让学生体会生活中的创新》一文在《创新周刊》上发表。

2006年，学校获县级社会综合治理先进单位，县级先进基层党组织和文明单位，学校的声誉正蒸蒸日上。