安徽中医学院图书馆于1959年建校时同时建立，2000年原安徽省医药学校图书馆并入。图书馆分为东区馆本部和西区分馆。已成为服务中医药教学、科研、医疗、开展中医药学术交流研究的
图书馆学信息中心。该馆馆藏各类纸质藏书53.86万余册，其中古籍线装书22000余册，现订阅中外文纸质期刊1300余种。总建筑面积约1.5万平方米。
馆藏各类纸质文献63万余册，订阅中外文纸质期刊1500余种。在中医药等领域积累了丰富的资源，其中《
医说》等三部古籍入选首批《国家珍贵古籍名录》。电子资源逐年增加，拥有
中国知网、万方数字化期刊、Springer、CBM、中国学位论文、中国药学文摘、中国中医药数据库
检索系统等中外文数据库十多个，超星、方正、书生、圣典、中数图等电子图书共68万余册，并有PubMed等网上免费资源及本馆自建数据库，所有馆藏资源均提供OPAC查询。为读者服务的服务器、
计算机共计230多台。
作为全校的文献信息中心和为教学与科研服务的学术性机构，图书馆以“读者第一、服务育人”为宗旨，履行教育和信息服务职能。业务工作现已全面实现了自动化，采用分室藏书、开架借阅、藏阅合一、电子监测、网络管理等方式，开展外借、阅览、参考咨询、信息检索、读者教育与培训、文献复制与传递等全方位信息服务。除古籍书外，所有书刊均实行全开架借阅，电子资源均在校园网上实行24小时免费服务。近年来年接待读者均在70万人次以上。
正式职工40人，其中硕士及本科学历20人，有高、
中级职称 15人，初步形成了一支结构较为合理的专业技术队伍。
该馆是中国中医药信息研究中心理事单位，中国中医药
图书馆学委员会成员单位，
安徽省图书馆专业委员会理事单位。作为全省中医药信息中心，该馆不断探索新的技术手段和服务方式，以期更深、更广地做好信息服务工作。