日照港集团有限公司于2004年02月24日在日照市工商行政管理局登记成立。公司经营范围包括码头和其他港口设施服务；在港区内从事货物装卸等。

2019年9月1日，2019中国服务业企业500强榜单在济南发布，日照港集团有限公司排名第238位。

2003年7月1日，日照至韩国平泽客箱班轮开通；2004年完成吞吐量5107.9万吨，2005年完成吞吐量8420.8万吨；2006年完成吞吐量1.07亿吨，开港20周年超过亿吨，全国沿海港口排名由第14位升至第9位；2006年10月17日，日照港股份有限公司A股在上海证券交易所成功上市；2007年完成吞吐量1.31亿吨；2008年吞吐量1.51亿吨。2003年以来，新增泊位22个，新增港口通过能力9518万吨。

日照港集团有限公司于2003年5月组建，由原日照港务局、岚山港务局企业部分联合设立。目前有13个部室、26个直属单位，固定员工8000余人，是一个拥有“港口业务、物流与贸易、建筑与制造、综合服务”四大业务板块的大型现代化企业集团，总资产达320多亿元。在2012年中国服务业企业500强排行榜中，日照港集团名列第174位。

2022年5月20日，莒南县人民政府与山东省港口集团有限公司日照港集团有限公司在日照市签署战略合作协议。