2002年，哈尔滨出版社与
台湾省及国外出版机构合作，在版权类图书的出版上闯出一片新天地。励志图书、人文经典、少儿注音文库等一系列精品图书成为了哈尔滨出版社新的出版特色，并创下品牌。励志经典系列中的《
致加西亚的信》成为哈尔滨出版社标志性图书，并长期居畅销书排行榜的前列。
2003年，哈尔滨出版社又与台湾出版机构合作，取得了《
三毛全集》和《
张爱玲典藏全集》在中国大陆地区惟一的合法出版权，这两套图书上市后在社会上引起了广泛的关注。
2006年，国家新闻出版总署副署长邬书林在省、市有关部门领导的陪同下，到哈尔滨出版社检查工作。哈尔滨出版社领导就出版社的历史与现状、改革与发展、经营与管理、未来发展规划向邬书林作了汇报，对哈尔滨出版社在出版工作上所取得的成就给予充分肯定，对朝气蓬勃、充满活力与进取精神的出版团队给予高度评价。
哈尔滨出版社主要出版社会科学、文学艺术、文化教育、实用生活等类图书。在励志经典系列图书、人文经典系列图书、商业成功典范系列图书、新智慧书房系列图书、财经管理规划系列图书、少儿阅读10元套系列图书等方面，也逐渐形成了自己的品牌效应，取得了广大读者的认可和好评。
在发展中壮大，建社20多年来，已将六千余种、一亿多册高文化含量、富有学术价值和实用价值的图书奉献给了广大读者。其中，有近三百种图书在全国及省级优秀图书评选中获奖，《中国药海》获
中国图书奖；五十余种图书远渡重洋，行销国外。《泰德漫画系列》图书获“2011我最喜爱的十大动漫图书奖”。
2021年11月24日，
黑龙江省哈尔滨市。网曝哈尔滨出版社出版的《汉语拼音拼读训练》一书中出现“屌”字，遭到家长质疑。对此，哈尔滨出版社工作人员表示，没有明文规定出版物不允许出现“屌”字，对幼儿来说，这个字确实不合适，下次修订时会做调整。