萌发沟的数量在不同的植物种类中有所差异。例如，油菜的花粉具有三条沟，而
苹果、梨、烟草等植物的花粉则带有三个孔洞。某些植物的花粉可能拥有多条沟或仅一条萌发沟。萌发沟通常是由外层
细胞壁变薄形成的区域，在花粉萌发过程中，花粉管会从此处伸展出。不同植物的花粉其萌发沟的形态和数量并不一致，较长的被称为沟，较短的则被称作孔。萌发沟的数量可以是从单个到多个，甚至有一些植物的花粉没有明显的萌发孔，比如
樟科植物。
萌发沟的存在是为了提供花粉管生长所需的通道，使得花粉能够在
传粉的过程中顺利地延伸并完成授粉过程。