他曾任杭师院地方史文化研究所所长、浙江历史文化研究所所长、
浙江大学亚欧旅游规划设计研究院院长、杭州古都文化研究会会长、
杭州市社会科学院兼职研究员、杭州研究院特邀研究员等职务。林正秋的研究领域广泛，包括临安宫廷、寺院遗址、园林建设、商铺字号、饮食菜谱、人口变化、历史人物、经济文化、海外贸易、科技史略等。他的研究成果丰富，出版了多部著作和论文。其中，他对南宋时期菜肴的研究最为人所知，成功还原了近一百道南宋宫廷及民间菜肴。
林正秋在
浙江省地方文化研究方面有着深厚的造诣，他系统化零碎的古籍和方志文献，找出湮没于世的文化。他的研究著作达30多部，学术论文130余篇。他因为精确算出由
西汉至
清代第一次鸦片战争前浙江省的人口变化数目的论文，获得浙江省及
杭州市自然科学优秀论文奖二项，论文收录入《中国人物丛书》。他的研究的特色就是跳出经院式的框框，将历史和现代结合，把研究化成生产力。例如他会在消防局为消防员上课，讲解考证为何杭州古代火灾特别多的原因；著作《浙江旅游与文化》成为热门旅游书；推广西湖申请世界遗产成功两周年，推出《西湖文化景观史》，系统化两千余年西湖文化历史。
林正秋对
南宋时期的饮食文化有着深入的研究，他成功还原了近一百道南宋宫廷及民间菜肴，这些菜肴现在已经成为
杭州市当地餐馆包括楼外楼等的知名菜式。他是《中国饮食大辞典》的主编，著有《中国宋代菜点概述》，经常与两岸的专家名厨交流。他还考证出杭州第一位吃螃蟹的人是
唐朝末期杭州城郊的女子。他应邀到酒厂研制宋代酒，指出酒厂的酿制方法出错，在他指导之下成功还原“东坡蜜酒”，这种酒获得
中原地区全国首届
食品博览会三等奖。