香港中文大学哲学系历史悠久。早于一九四九年，成员书院新亚书院创办哲学教育系。两年后，
香港中文大学崇基学院成立，即开设人生哲学一课，并于一九六三年成立宗教知识及哲学学系，及后易名为哲学及宗教学系。二者皆为中大哲学系的前身。一九七七年，大学改制，两书院之哲学系正式合并，成为
香港中文大学哲学系。
该系早期由知誉于国际、称重于杏檀的前辈学者
唐君毅教授、
牟宗三教授、
劳思光教授等先生主持教务。在他们的辛勤耕耘下，该系得以秉承深厚的中国人文传统，发展成国际公认的中国哲学重镇，其中以新儒学研究的成绩最为显著。
从七十年代开始，该系邀得自北美归来的
刘述先教授、何秀煌教授等加入。这一代学者洞悉
香港特别行政区处于东亚的地缘优势，抱著促进中西文化交流的使命感，于罗致人才方面采取相容并蓄的态度，于教学和研究方面，著力于推动中西哲学并重，缔造多元和自由的教研环境。
香港中文大学哲学系致力于提供多元化、均衡的课程，包含东西方传统之哲学，既符合国际标准，又保持国家和本地的特色。该系的文学士课程旨在提供优良的人文教育，既为学生建立良好的学术研究基础，以继续深造，又培养学生的批判思考及沟通的能力，为应付日后工作和生活的挑战作好准备。该系的研究院课程则著重于从事哲学专门研究的培训，培养学生独立严谨的治学精神。此外该系教师亦一直热烈投入大学通识教育的推广和大学教育理念的探讨。该系约有一半课程为通识教育。开办该类课程不仅为该系累积了丰富的人文教育经验，亦对
香港中文大学整体教育方向的厘定以及大学形象的建立，发挥了积极的作用。
该系致力于发展不同哲学领域研究的优势，如
分析哲学、中国哲学、
现象学、社会政治哲学，以及
伦理学及
应用伦理学。该系特别强调中西哲学的比较作为教学与研究的核心课题，以配合中文大学促进中国文化现代化及研究的宗旨。
除了教学活动外，该系亦积极举办及参与各类型的学术活动，如学术会议、研讨会、学术交流、公开讲座及专业学术论著的出版等。该系一直秉承深厚的中国人文传统，又为中西哲学研究及学术交流的中心。在维系其独有传统之余，该系将继续发展比较哲学，希望能为中西哲学的未来开拓出更广阔的视野和天地。
该系教员来自中国大陆、
香港特别行政区、
台湾省及北美，并分别在美国、
加拿大、
德国、
法国、澳洲、中国大陆、台湾及香港学府完成高级学位。他们的研究领域包括中国哲学、社会及政治哲学、
伦理学及
应用伦理学、美学、知识论、形上学、逻辑、语言哲学、心灵哲学、法律哲学、历史哲学、
现象学、诠释学、古希腊思想、德国哲学、当代法国哲学、现代性和后现代性问题以及比较哲学。