国民政府组成“南路联军总指挥部”，由
朱培德任南路总指挥。中共广东区委为配合这次行动，成立了南路特别委员会，共产党员
朱克靖、
张善铭、廖乾五等带领政治工作人员深入民众，大力开展宣传和组织工作。南征部队于1925年12月占领
钦州市、
雷州市后，1926年1月又渡海作战，收复
海南岛。邓本殷逃亡，残部被缴械收编，至2月被全部肃清。
经过两次
国民革命军东征和此次南征，长期四分五裂的
广东省得到统一，为准备北伐战争提供了比较巩固的后方基地。
国民革命军南征是1925年10月到1926年2月，国民革命军讨伐占据广东西南部地区军阀
邓本殷的作战。1925年9月，高雷罗阳钦廉
海南省八属善后督办、南路八属联军总指挥邓本殷，指挥所部约2万人，由
高州市（今
茂名市）、
阳江市分三路北犯，相继攻占
罗定市、
云浮市、
肇庆市等县城，妄图配合军阀陈炯明军进占广州。为消灭广东各军阀势力，巩固革命根据地，
国民政府在国民革命军主力第二次东征
陈炯明的情况下，令第4军和
桂军各一部共1.8万余人组成南征军，辖3个纵队，任第4军第10师师长
陈铭枢为总指挥，率师南征。
兵分三路：第2、第3纵队由
江门市、
新会区、台山白沙、
开平市出发，分向罗定、
信宜市和
恩平市、
阳春市进攻；第1纵队驻茂名（今高州），待机进攻高州。正当第2、第3纵队准备开进之际，10月16日邓军分三路来攻，遂改变部署，令各部向江门集中待机。18日，第3纵队所辖之第4军第12师师长
梁鸿林率部在开平叛变，被迫再次改变部署，将主力集中于单水口（今属开平）布防待援。
国民政府急令第3军一部驰援。26日，邓军一部和叛军梁鸿林部共约8000人向单水口发动攻击。南征军殊死苦战至29日，第3军驰援部队抵达加入战斗，将邓军击退，使战局转危为安。11月1日，国民政府为加强南征军，改任第3军军长
朱培德为总指挥。随即调整部署：第3纵队改为第1路，新增调的第3军第7师和第2军第6师分别为第2路和第3路，第1纵队改为第4路，第2纵队改为右侧支队。南征军遂分四路向邓军发起反攻，至7日连克
恩平市、新兴、
阳江市。19日，集中兵力向邓军总部
高州市攻击，次日攻占该地。邓率部向
廉江市溃逃。南征军跟踪追击，至12月7日相继攻克廉江、
廉州镇（今
合浦县）、
钦州市（今属广西）、
雷州市（今海康）。邓率残部逃往
海南省（今属海南）。南征军奉命回原防地休整。
为彻底消灭邓军，
国民政府在
国民革命军东征结束后，任第4军军长李济深为南征军总指挥，率部肃清退守琼崖的邓军残部。1926年1月15日，南征军由雷州、
徐闻县乘船渡海。21日起在新埠（今属
海口市）陆续登陆，随即展开围歼邓军，至2月将其全部肃清。至此，
广东省完全统一，为尔后举行的北伐战争准备了比较巩固的后方基地。