至道二年二月，内侍高班内品裴愈奏：昨到越州，见晋王羲之兰亭曲水及书堂旧基等处，得僧子谦状，乞赐御书，收掌于书堂上，建一寺舍，焚修崇奉。宸翰特赐天章寺额。”又“或谓仁宗书此额时，本书真宗御集阁为天章之阁，四字既成，圣意未惬，再书之，前本遂不用，有内侍奏章献明肃皇太后，言越州天章寺，天下名山，今欲乞皇帝更书一寺字，易阁字，以赐越州，太后与上皆欣然许之。”可见此寺曾为朝廷所重。
南宋时，
陆游有《大雨中离三山宿天章寺》、《秋夜闻兰亭天章寺钟》诗。
元初，西僧
杨琏真迦盗掘宋六陵，义士
唐珏等潜往，收得诸帝遗骸，葬于天章寺前，上载冬青树，以志识别，至明初返葬六陵。明永乐六年（1408），僧智谦重建天章寺。寺有
铁罗汉、铁钟，后存他处。民国初尚见规模，至1939年已是瓦砾
蔓草，一片荒凉，惟殿门残存，有罗坤书“胜地名蓝”一匾，于无人过问中硕果仅存，在风雨中剥蚀。今寺已不存。
宋·
曾巩《游天章寺》：“篮舆朝出踏轻尘，拂面毵柳色新。曲水岂能留往事，南湖空解照行人。最宜灵运登山屐，不负渊明漉酒巾。老去飘零心未折，暂须同醉海边春。”
据史料记载，天章寺是
北宋至道年间在兰亭旧址上建造的，历代屡经兴废，明永乐元年重修，民国二十九年被侵华日军焚毁。考古发掘工作对于更好地进行兰亭的保护规划具有重要意义。
考古队挖掘了纵、横二条主线和局部几个重点区域，在多处发现了古石板、石柱、
地基、石墩、砖刻、瓦片以及一些宋代的陶瓷碎片，通过目前掌握的情况，考古队基本确定了天章寺的具体方位，初步断定天章寺庙共有三层进深。