单县中心医院位于菏泽市单县文化路一号，始建于1944年，是一所三级甲等综合医院，是单县医保和新型农村合作医疗定点医院，先后荣获全国卫生系统先进集体、全国百姓放心示范医院、国家级爱婴医院、山东省医德医风示范医院、山东省百佳医院、山东省卫生系统行业作风建设先进集体、山东省卫生计划生育系统先进集体、山东省文明单位等荣誉称号。

1944年，医院前身-冀鲁豫第十一专署医院创建。

1946年，医院更名为冀鲁豫边区第三政民医院。

1958年，医院更名为山东省单县中心医院。

2014年，医院被评定为国家三级甲等综合医院。

2021年3月，单县中心医院被评为抗击新冠肺炎疫情山东省三八红旗集体。

2022年4月，单县中心医院团委入选“山东省五四红旗团委”拟表彰对象名单。

消化内科、血液内科、肾内风湿科、呼吸内科、内分泌科、心血管内科、神经内科、肿瘤学、传染科、普外科、骨科、胸心外科、泌尿外科、神经外科、烧伤整形小儿外科、妇产科、小儿科、眼科、耳鼻咽喉-头颈外科、口腔外科、口腔内科、皮肤科、手术麻醉科、疼痛科、中医科、重症医学科（ICU）、急诊医学科、康复医学科、康复理疗针灸科、检验科、输血科、核医学科、医学影像科、病理科、心电检查科、脑电图室、高压氧科等临床科室和医技科室。