广东省钟南山医学基金会是在钟南山院士领导下，由呼吸疾病国家重点实验室产学研基地、国家呼吸医学中心产学研分中心发起，以钟南山院士名字命名，于2011年7月5日正式注册成立的独立法人非公募基金会。基金会名誉理事长为钟南山院士，荣获广东省“AAA”级社会组织称号，并于2018年5月被广东省民政厅认定为慈善组织。

2020年2月13日，马云公益基金会、阿里云、广东省钟南山医学基金会、广州呼吸健康研究院四方签署合作框架协议，加速推进新型冠状病毒肺炎的临床救治关键技术、有效药物研发及新型冠状病毒疫苗研发等科研攻关。