吴孔军，男，
汉族，1965年8月出生，河南商城人。
河北地质大学水文地质与工程地质专业学习，本科学历。
人物履历
1985年9月至1989年7月，在河北地质学院(现河北地质大学)水文地质与工程地质专业学习，本科学历。
1989年7月至2015年6月，在
河南省地质矿产勘查开发局工作，历任
地球物理学勘查队副队长、
测绘学队队长、局办公室主任，局党委委员、副局长。
2015年7月至2018年11月，任
河南省国土资源厅党组成员、省国土资源开发投资管理中心主任。
2018年11月，任
河南省自然资源厅党组成员、河南省国土资源开发投资管理中心主任。
曾任河南省交通运输厅党组成员、副厅长。
任免信息
2020年1月14日，河南省人民政府官网更新任免一批干部，其中：任命吴孔军为河南省交通运输厅副厅长，免去其河南省国土资源开发投资管理中心主任职务。
2023年3月消息，河南省人民政府发布一批人事任免通知，免去吴孔军的河南省交通运输厅副厅长职务，任命吴孔军为河南省人民政府副秘书长。