黑龙江大学农学院，是由中国农业部、中国农业科学院、中国农学会、黑龙江省科学院共建，以中国农业科学院甜菜研究所、黑龙江大学生命科学院为基础，于2003年8月成立。中国农业科学院甜菜所始建于1959年，是农业部直属专业科研机构。

学院多年来将教学、竞赛、科研并重，是国家级“卓越农林人才培养计划”试点高校，设有“国家级农林学科人才培育基地”，“国家级农林人才试点实验班”，享有“研究生推免”资格。

学院科研实力领先全国，拥有3个国家级重点实验室，2个国家级工程研究中心，农林类国家级实验室数量位列黑龙江省第一，设有中国农业科学院-国家甜菜改良中心，教育部杂种优势研究与利用重点实验室、教育部玉米育种工程中心、农业部作物基因组学与遗传改良重点开放实验室、农业部农学与耕作学重点开放实验室、农业部分子植物病理学重点开放实验室、农业部农作物病虫草害生物防治资源研究与利用重点开放实验室、黑龙江省果树逆境生理与分子生物学重点实验室、黑龙江省作物遗传改良重点开放实验室等28个部级重点实验室或研究中心。

该所设有遗传改良、遗传资源、资源环境及引种与区试四个学科。国家糖料作物改良中心和农业部甜菜质量监督检验测试中心挂靠在该所。

该院目前有专业教师42人，其中教授20人、副教授15人、讲师7人，博士生导师15人、硕士生导师10人。自1987年开始，作物遗传育种、作物栽培与耕作学、植物营养学、农业昆虫与害虫防治等专业列入中国农业科学院研究生院硕士研究生招生计划；植物营养学、农业昆虫与害虫防治自2003年列入中国农业科学院研究生院博士研究生招生计划；设有作物遗传育种、农业昆虫与害虫防治2个硕士点。2003年12月建成黑龙江大学甜菜研究所博士后工作站。

该院以黑龙江大学呼兰校区为实践教学基地，2004年10月在校本部已建成1.5万平方米的农学楼，并已投入使用，为广大师生提供优良的教学、科研环境。