沈德中，从事环境微生物学、微生物生态学研究和教学近20年。近年来将研究领域扩大到持续农业持续发展和绿色食品等方面。主要研究目标是污染物的生物降解、废物的再生和农业利用、病害的生物防治以及绿色食品有机食品的生产等。积极开展微生态工程原理与应用的研究，即通过对微生物调控防治污染、控制病害发生发展、促进作物和畜禽生长。曾获北京市科技进步三等奖，发表论文20余篇。在校内讲授《环境微生物学》和《微生物生态学》等本科和研究生课程。

1995年，他发表了《重金属对水稻田土壤中藻类数量和种类的影响》。2002年3月1日，沈德中创作的《污染环境的生物修复》由化学工业出版社出版。2003年，他先后创作了《环境微生物学》《环境和资源微生物学》。2012年5月23日至24日，他到山东省曹县砖庙镇李路相村就该村农业发展问题进行考察。