同安博物馆设置两个展厅及一个露天陈列园。大成殿展厅有《同安重要史迹陈列》、《同安历史名人陈列》、《馆藏文物陈列》三个部分。史迹陈列，是通过图片、文字及文物资料，反映古同安区新石器时代至新民主主义革命时期重要的历史事件及重要的历史人物的活动情况。

同安博物馆设在同安孔庙内，1986年筹建，1990年元月对外开放。占地7000多平方米，建筑面积1400多平方米。

名人陈列，有宋代伟大科学家苏颂、清代民族英雄陈化成、近代华侨旗帜陈嘉庚等一批本地名人生平事绩，表现同安先贤的伟绩。

馆藏文物陈列，包括宋代同安汀溪青瓷器（亦称珠光瓷）等300多件有代表性实物。展现历史生活侧面及古近代劳动人民的艺术创造力。

两廊展厅，举办专题展览，如《馆藏古书画展》、《同安书画家书画作品展》、《厦门书画家书画作品展》、《同安现代农民画展》等。

石雕陈列园，展出同安区从宋至今各种石雕碑刻300多件，内容有关民俗、宗教、建筑、生产等方面，具有鲜明的地方特色。在石雕园中，有唐朝镇墓兽、宋西安桥镇桥石将军、清阮翁仲等，形态逼真，工艺精湛，被称为“同安兵马俑”。同安博物馆馆藏文物及标本2000多件。