港珠澳大桥管理局（Hong Kong-Zhuhai-Macao Bridge Authority）是由香港特别行政区政府、广东省人民政府和澳门特别行政区政府共同举办的事业单位，主要承担港珠澳大桥主体部分的建设、运营、维护和管理的组织实施工作。

2003年8月，国务院批准开展本项目前期工作，同意成立由香港特区政府作为召集人，粤港澳三方组成的“港珠澳大桥前期工作协调小组”，负责协调前期工作有关事宜。

2004年3月，前期工作协调小组办公室成立。

2006年12月，国务院批准成立由中华人民共和国国家发展和改革委员会牵头的“港珠澳大桥专责小组”，负责重大问题的协调。在“专责小组”和“前期工作协调小组”的领导下，协调小组办公室承担起了艰巨的大桥前期工作任务，协调三地政府逐项解决了两岸登陆点、桥位方案、投融资等多个重大问题。

2009年10月28日，国务院常务会议正式批准港珠澳大桥工程可行性研究报告，标志着港珠澳大桥前期工作顺利完成，工程正式进入实施阶段。

2009年12月15日，李克强副总理亲临珠海市宣布港珠澳大桥正式开工。

2010年7月，港珠澳大桥管理局成立。管理局将以贯通三地交通、经济、文化的广阔视野，以科学高效的管理思路，严谨务实、阳光运作积极推动港珠澳大桥主桥的建设，并积极配合大桥各区部分的实施，确保港珠澳大桥的顺利建设和运营管理，以实现“建设一流的跨海通道，为用户提供优质服务，成为地标性建筑”的项目建设目标。

2020年5月，被人力资源社会保障部、交通运输部评为“全国交通运输系统先进集体”。