商飞卿，字翚仲，台州临海人。

商飞卿最初担任无为军教授，后来晋升为工部郎。在韩侂胄掌权期间，商飞卿拒绝依附，因此很快请求离职。随后，他被外放到福建路，担任常平茶盐事的提举。不久之后，商飞卿被召回朝廷，授予监察御史一职。然而，因为他再次违背了韩侂胄的意愿，他被任命为秘阁修撰，并出使荆湖路担任转运判官。在此期间，他还曾担任司农卿，负责管理江东、淮西地区的财政事务。开禧初年，商飞卿被提升为户部侍郎。在开禧二年的战争中，商飞卿被委派为粮饷总管。由于战争导致粮食供应紧张，他在前线视察军队时，遭遇金兵的大规模进攻，宋军惨败，商飞卿也因此积劳成疾，不幸逝世。