中药标准化技术国家工程实验室作为
中华人民共和国国家发展和改革委员会首批批复的工程实验室之一，其建设期为三年。实验室采用理事会领导下的实验室主任负责制，中科院
中国科学院上海药物研究所担任首届理事长单位。实验室在科研项目选择、技术研发、国际合作等方面实施开放、合作、资源共享、流动的运行机制。
实验室的研究重点在于解决中药产业面临的中药标准和质量控制关键技术问题，以促进中药的现代化和国际化进程。同时，实验室的工作也满足了《
中华人民共和国药典》不断修订的需求。实验室的目标是在中药材、饮片、提取物及中药制剂的质量控制技术和标准研究方面达到国际领先水平，提高我国在国际植物药标准领域的影响力，并培养一批高水平的中药
标准化技术研究人才。
中药标准化技术国家工程实验室拥有一支年轻且专业知识丰富的研究团队，共有研究人员86名，平均年龄36岁，其中正高级职称13人，副高级职称26人，超过60%的研究人员拥有博士学位。实验室在中药标准化技术研究方面积累了丰富经验，建立了包含7,000个中药或天然药物化学成分的样品库，并为100多家企业提供中药标准服务，制定了50多种常用中药材、饮片或中成药的质量标准，许多已被提升为国家标准。实验室还建立了符合中药复杂体系特点的中药标准研究方法学体系，并发表了130多篇SCI论文，在国际上产生了一定的影响。
中药标准化技术国家工程实验室的合作单位涵盖了科研院所、高校和企业，包括国家中药制药工程技术研究中心、
上海华宇药业有限公司、
成都地奥集团、中科院成都生物研究所、中科院长春应用化学研究所、中科院大连化学物理研究所、
中国人民解放军海军军医大学和
上海中医药大学等。