广州水上巴士航线共有14条航线、35个码头、51艘营运船舶，总里程58.8公里，是
广州市继公共汽车、出租车、地铁后的第4套公交系统，为缓解陆上交通压力、服务市民出行起到了较好的作用。
航线
S1线路
途径站点：
航线时间：
金沙洲码头：07:00-18:00
黄沙码头：07:30-18:30
班次间隔：
金沙洲码头：（工作日）07:00 08:00 17:00 18:00
黄沙码头：（工作日）07:30 08:30 17:30 18:30
S2线路
途径站点：
航线时间：
工作日：
07:00 08:00
S3线路
途径站点：
航线时间：
06:10-21:50(坦尾码头)
06:00-22:00(如意坊码头)
班次间隔：
20分钟
S4线路
途径站点：
航线时间：
06:45-20:22(西堤码头)
06:52-20:30(洲码头)
班次间隔：
西堤码头：09:08-10:52 17:08-20:08 每小时四班
07:10-08:50 11:10-16:50 间隔20分钟一班
鳌洲码头：09:00-10:45 17:00-20:00 间隔15分钟一班
07:00-09:00 11:00-16:40 间隔20分钟一班
S5线路
途径站点：
航线时间：
第一段07:15-19:45
第二段05:45-22:00
班次间隔：
鱼珠码头-新洲码头：60分钟
新洲码头-深井码头：高峰期间隔20分钟 其他时段每30分钟
S6线路
途径站点：
航线时间：
06:00-22:00
班次间隔
每10分钟一班
S7线路
途径站点：
航线时间：
06:45-19:00(天字码头)
06:38-18:52(纺织码头)
班次间隔：
天字码头：每15分钟一班
纺织码头：每小时四班
S8线路
途径站点：
航线时间：
07:00-18:30(省总码头)
07:08-18:38(堑口码头)
班次间隔：
堑口码头：每15分钟一班
省总码头：每小时四班
S9线路
途径站点：
航线时间：
07:00-18:30(白蚬壳码头)
07:10-18:40(白鹤洞码头)
班次间隔：
高峰时段 20分钟
(07:00-08:20/17:10-18:30 白蚬壳码头)
(07:10-08:30/17:00-18:40 白鹤洞码头)
其他时段 30分钟
S10线路
途径站点：
航线时间：
05:45-23:50(鱼珠码头)
05:45-24:00(长洲码头)
班次间隔：
不定开船(07:00-09:00/17:00-19:00)
夜班船(22:00以后)30分钟
其他时段15分钟
S12线路
途径站点：
长洲码头-鱼珠码头-海心沙码头
航线时间：
如约定制发班
S13线路
途径站点：
航线时间：
07:05-18:25
班次间隔：
40分钟
S14线路
途径站点：
航线时间：
如约定制发班
特点
票价
安全性
船上有救生衣、晕船药。
具体航线
最新消息
“水巴一日通”正式发售
“水巴一日通”通票在2015年4月15日正式发售。只要通票在手，在周一至周五的非节假日时间里，可以一天之内，在芳村-广州塔水巴航线任一码头站点、任一航班时间（当日结束营运前），任意上下船。
市民可在芳村码头、
黄沙码头、
西堤码头、
天字码头、大元帅府码头、
中大码头、
广州塔码头购买到通票，推广期间每张通票售价20元。目前“水巴一日通”通票适用于周一至周五，周末及节假日暂不适用。
购买“水巴一日通”通票，除了能够在当天营运时间内无限次乘坐芳村-
广州塔航线的观光席，还可以在芳村-广州塔航线沿岸码头加盖纪念戳免费寄给亲朋好友，另外还可获赠一份“水巴一日通游玩攻略”。
海心沙码头新址启用
2015年7月19日，
广州市客轮公司通报称，
海心沙公园码头新址正式启用，新址位于广州海心沙亚运主题公园南侧，公交接驳更
方便，步行约5分钟可达地铁
海心沙站。新址启用后，水巴S11（广州塔—海心沙）航线以及高峰S12（长洲—鱼珠—海心沙）航线途经的海心沙码头对应搬至新址营运。据了解，客轮公司正积极地与海心沙亚运主会场景区管理方协调争取早日航班正常营运。