滨州医学院附属医院开诊于1977年10月，1995年5月被确认为
三级甲等医院，2020年7月与滨州医学院第一临床医学院合署。2021年9月，滨州医学院附属医院重症医学科被评选为第20届全国青年文明号。
医院设有呼吸内科、
消化内科、心血管内科、血液内科、神经内科、肾内科、内分泌科、风湿免疫科、老年医学科、神经外科、心脏大血管外科、胸外科、
甲状腺乳腺外科、胃肠外科、肛肠（疝）外科、烧伤整形
美容外科、骨关节外科、创伤骨科、手（显微）外科、足外科、脊柱外科、泌尿外科、肝胆外科、儿外科、
妇科学、
产科学、
小儿科、眼科、耳鼻咽喉头颈外科、口腔科、皮肤性病科、感染性疾病科、
肿瘤学、急诊科、康复医学科、疼痛科、麻醉科、中医科、血管介入医学与血管外科、生殖医学科、健康体检管理部、检验科、病理科、放射科、超声医学科、核医学科、中心实验室、药学部、输血科、
临床医学实验室、临床营养科、儿童保健科、
内镜室等临床和医技科室。
获得全国城市医院思想政治工作“先进集体”、“全国首批管理创新示范单位”、山东省卫生系统“先进集体”、“优质服务白求恩杯”、“三学三创优胜单位”、
山东省卫生厅“文明单位”，全省防治非典型肺炎工作“先进集体”、全省卫生系统廉洁行医树新风“先进单位”、“全省医疗质量效益年活动先进集体”等多项荣誉称号。
2022年9月20日，据齐鲁壹点报道，滨医附院成功获批
山东省骨科与运动康复临床医学研究中心分中心。
2023年1月消息，滨州医学院附属医院与
阳信县人民医院合作签约仪式在阳信县人民医院成功举办，滨州医学院附属医院阳信医院正式挂牌。
2023年5月，滨州医学院附属医院牵头成立暨黄河三角洲医务管理论坛暨
滨州市医疗管理质量控制中心2023年年会。