颉伟，男，1981年出生，博士，清华大学生命科学学院研究员。1999-2003年，北京大学生命科学学院，获学士；2003-2008年，美国加州大学洛杉矶分校，获博士学位；2006-2008年，美国加州大学洛杉矶分校，获硕士学位；2008-2009年，美国加州大学洛杉矶分校博士后；2009-2013年，美国圣迭戈Ludwig肿瘤研究所，加利福尼亚大学-圣地亚哥分校博士后；2013年起，任清华大学生命科学学院研究员。

2019年9月20日，荣获“科学探索奖”，肯定他在生命起始时期亲代到子代表观基因组的遗传和重编程模式、机制与功能领域做出的科学发现，鼓励他在动物早期胚胎发育过程中基因表达和发育程序启动的深入探索。

颉伟，男，1981年出生，博士，清华大学生命科学学院研究员。

1999-2003年，北京大学生命科学学院 生物科学 学士

2003-2008年，美国加州大学洛杉矶分校 分子生物学 博士

2006-2008年，美国加州大学洛杉矶分校 统计学 硕士

2008-2009年，美国加州大学洛杉矶分校 博士后

2009-2013年，美国圣迭戈Ludwig肿瘤研究所，加利福尼亚大学-圣地亚哥分校 博士后

2013年-， 清华大学生命科学学院 研究员

2019年9月20日，获得“科学探索奖”-生命科学。

2022年12月，荣获2021年度北京市科学技术奖杰出青年中关村奖。

研究兴趣包括表观遗传学，基因组学和发育生物学。同时利用分子生物学、发育生物学和计算生物学的方法，采用干湿实验结合的方式，研究干细胞分化和个体发育以及人类疾病中的表观遗传调控机制。本实验室将致力于：（1）动物胚胎早期发育过程中的表观遗传调控；（2）干细胞分化过程中的表观遗传调控；（3）调控序列如启动子、增强子、绝缘子以及三维基因组在发育和细胞命运决定过程中的功能；（4）表观遗传相关人类疾病的调控机理。

# Correspondence author

* First author

1.Weikun Xia,* Jiawei Xu,*,# Guang Yu,* Guidong Yao,* Kai Xu,？ Xueshan Ma,？ Nan Zhang,？ Bofeng Liu, Tong Li, Zili Lin, Xia Chen, Lijia Li, Qiujun Wang, Dayuan Shi, Senlin Shi, Yile Zhang, Wenyan Song, Haixia Jin, Linli Hu, Zhiqin Bu, Yang Wang, Jie Na, Wei Xie, Ying-Pu Sun# (2019). Resetting histone modifications during human parental-to-zygotic transition. Science (In press).

2.Hui Zheng,Wei Xie (2019). The role of 3D genome organization in development and cell differentiation. Nature Reviews Molecular Cell Biology.

3.Qianhua Xu,* Yunlong Xiang,* Qiujun Wang,* Leyun Wang,* Julie Brind’Amour, Aaron Blair Bogutz, Yu Zhang, Bingjie Zhang, Guang Yu, Weikun Xia, Zhenhai Du, Chunyi Huang, Jing Ma, Hui Zheng, Yuanyuan Li, Chao Liu, Cheryl Lyn Walker, Eric Jonasch, Louis Lefebvre, Min Wu, Matthew C. Lorincz, Wei Li, Li Li \u0026 Wei Xie (2019). SETD2 regulates the maternal epigenome, genomic imprinting and embryonic development. Nature genetics 51 (844-856).

4. Yao Wang,* Hanben Wang,* Yu Zhang,* Zhenhai, Du,* Wei Si,* Suixing Fan, Dongdong, Qin, Mei Wang, Yanchao Duan, Lufan Li, Yuying Jiao, Yuanyuan Li, Qiujun Wang, Qinghua Shi, Xin Wu, Wei Xie(2019). Reprogramming of Meiotic Chromatin 建筑 during Spermatogenesis. Molecular Cell 73 (547-561).

5. Bingjie Zhang* Xiaotong Wu,* Wenhao Zhang,* Weimin Shen, Qingrui Sun, Kaili Liu, Yu Zhang, Qiujun Wang, Yuanyuan Li, Anming Meng, Wei Xie (2018) Widespread enhancer dememorization and promoter priming during parental-to-zygotic transition. Molecular Cell 72 (673-686).

6. Jingyi Wu,* Jiawei Xu,* Bofeng Liu,* Guidong Yao,* Peizhe Wang,* Zili Lin,* Bo Huang, Xuepeng Wang, Tong Li, Senlin Shi, Nan Zhang, Fuyu Duan, Jia Ming, Xiangyang Zhang, Wenbin Niu, Wenyan Song, Haixia Jin, Yihong Guo, Shanjun Dai, Linli Hu, Lanlan Fang, Qiujun Wang, Yuanyuan Li, Wei Li, Jie Na,Wei Xie\u0026 Yingpu Sun (2018) Chromatin analysis in human early development reveals epigenetic transition during ZGA. Nature557 (256–260).

7. Qianhua Xu, Wei Xie (2018) Epigenome in Early Mammalian Development: Inheritance, Reprogramming and Establishment. Trends in Cell Biology 28 (3).

8. Yuanyuan Li,* Hui Zheng,* Qiujun Wang, Chen Zhou, Lei Wei, Xuehui Liu, Wenhao Zhang, Yu Zhang, Zhenhai Du, Xiaowo Wang, Wei Xie (2018) Genomewide analyses reveal a role of Polycomb in promoting hypomethylation of 脱氧核糖核酸 methylation valley. Genome Biology 19 (18).

9. Yu Zhang,* Yunlong Xiang,* Qiangzong Yin,* Zhenhai Du,* Xu Peng, Qiujun Wang, Miguel Fidalgo, Weikun Xia, Yuanyuan Li, Zhenao Zhao, Wenhao Zhang, Jing Ma, Feng Xu, Jianlong Wang, Lei Li, Wei Xie(2018) Dynamic epigenomic landscapes during early lineage specification. Nature Genetics50 (96-105).

10. Zhenhai Du, Hui Zheng, Bo Huang, Rui Ma, Jingyi Wu, Xianglin Zhang, Jing He, Yunlong Xiang, Qiujun Wang, Yuanyuan Li, Jing Ma, Xu Zhang, Ke Zhang, Michael Q. Zhang, Juntao Gao, Jesse R. Dixon, Xiaowo Wang, Jianyang Zeng, Wei Xie (2017) Allelic reprogramming of 3D chromatin 建筑 during early mammalian development. Nature 547 (232-235).

11. Yuwen Ke,* Yanan Xu,* Xuepeng Chen,* Songjie Feng,* Zhenbo Liu, Yaoyu Sun, Xuelong Yao, Fangzhen Li, Wei Zhu, Lei Gao, Haojie Chen, Zhenhai Du, Wei Xie, Xiaocui Xu, Xingxu Huang,#and Jiang Liu#(2017) 3D Chromatin Structures of Mature Gametes and Structural Reprogramming during Mammalian Embryogenesis. Cell 170 (357-381).

12. Reinhard Brunmeir*, Jingyi Wu*, Xu peng, Sun-Yee Kim, Sofi G. Julien, Qiongyi Zhang, Wei Xieand Feng Xu (2016) Comparative Transcriptomic and Epigenomic Analyses Reveal New Regulators of Murine 褐色 Adipogenesis. PLoS Genetics 12(12): e1006474.

13. Wenhao Zhang,* Weikun Xia,* Qiujun Wang, Aaron Towers, Jiayu Chen, Rui Gao, Yu Zhang, Chia-an 日元, Ah Young Lee, Yuanyuan Li, Chen Zhou, Kaili Liu, Jing Zhang, Xiuqi Chen, Zai Chang, Danny Leung, Shaorong Gao, Yong-hui Jiang, Wei Xie(2016) Isoform switch of TET1 regulates demethylation and mouse development.Molecular Cell 64 (1-12).

14. Xiaozhe Xiong, Tatyana Panchenko, Shuang Yang, Shuai Zhao, Peiqiang Yan, Wenhao Zhang, Wei Xie, Yuanyuan Li, Yingming Zhao, C David Allis \u0026 Haitao Li (2016) Selective recognition of histone crotonylation by double PHD fingers of MOZ and DPF2. Nature Chemical Biology 12, (1111–1118).

15. Bingjie Zhang,* Hui Zheng,* Bo Huang,* Wenzhi Li,* Yunlong Xiang, Xu Peng, Jia Ming, Xiaotong Wu, Yu Zhang, Qianhua Xu, Wenqiang Liu, Xiaochen Kou, Yanhong Zhao, Wenteng He, Chong Li, Bo Chen, Yuanyuan Li, Qiujun Wang, Jing Ma, Qiangzong Yin, Zai Chang, Kehkooi Kee, Anming Meng, Shaorong Gao, Feng Xu, Jie Na, Wei Xie(2016). Allelic reprogramming of the histone modification H3K4me3 in early mammalian development. Nature537 (553-557).

16. Hui Zheng,* Bo Huang,* Bingjie Zhang,* Yunlong Xiang, Zhenhai Du, Qiujun Wang, Yuanyuan Li, Jing Ma, Xu Peng, Zai Chang, Feng Xu, Wei Xie (2016). Resetting epigenetic memory by reprogramming of histone modifications in mammals. Molecular Cell 63 (1066-1079).

17. Jingyi Wu,* Bo Huang,* He Chen, Qiangzong Yin, Yang Liu, Yunlong Xiang, Bingjie Zhang, Bofeng Liu, Qiujun Wang, Weikun Xia, Wenzhi Li, Yuanyuan Li, Jing Ma, Xu Peng, Hui Zheng, Jia Ming, Wenhao Zhang, Jing Zhang, Geng Tian, Feng Xu, Zai Chang, Jie Na, Xuerui Yang, Wei Xie (2016). The landscape of accessible chromatin in mammalian preimplantation embryos. Nature 534 (652-657).

18. Bo Xia, Dali Han, Xingyu Lu, Zhaozhu Sun, Ankun Zhou, Qiangzong Yin, Hu Zeng, Menghao Liu, Xiang Jiang, Wei Xie, Chuan He \u0026 Chengqi Yi (2015). Bisulfite-free, base-resolution analysis of 5-formylcytosine at the genome scale. Nature Methods 12,1047–1050.

19. Danny Leung*, Inkyung Jung*, Nisha Rajagopal*, Anthony Schmitt, Siddarth Selvaraj, Ah Young Lee, Chia-An 日元, Shin Lin, Yiing Lin, Yunjiang Qiu, Wei Xie, Feng Yue, Manoj Hariharan, Pradipta Ray, Samantha Kuan, Lee Edsall, Hongbo Yang, Neil C. Chi, Michael Q. Zhang, Joseph R. Ecker \u0026 Bing Ren (2015). Integrative analysis of haplotype-resolved epigenomes across human tissues.Nature518, 350-354.

20. Jesse R. Dixon*, Inkyung Jung*, Siddarth Selvaraj*, Yin Shen, Jessica E. Antosiewicz-Bourget, Ah Young Lee, Zhen Ye, Audrey Kim, Nisha Rajagopal,Wei Xie, Yarui Diao, Jing Liang, Huimin Zhao, Victor V. Lobanenkov, Joseph R. Ecker, James A. Thomson \u0026 Bing Ren (2015). Chromatin 建筑 reorganization during stem cell differentiation.Nature518, 331-336.

21. Wei Xie,Bing Ren(2013) Enhancing Pluripotency and Lineage Specification,Science341:245-7

22. Wei Xie, Matthew D. Schultz, Ryan Lister, Zhonggang Hou, Nisha Rajagopal, Pradipta Ray, John W. Whitaker, Shulan Tian, R. David Hawkins, Danny Leung, Hongbo Yang, Tao Wang, Ah Young Lee, Scott A. Swanson, Jiuchun Zhang, Yun Zhu, Audrey Kim, Joseph R. Nery, Mark A. Urich, Samantha Kuan, Chia-an Yen, Sarit Klugman, Pengzhi Yu, Kran Suknuntha, Nicholas E. Propson, Huaming Chen, Lee E. Edsall, Ulrich Wagner, Yan Li, Zhen Ye, Ashwinikumar Kulkarni, Zhenyu Xuan, Wen-Yu Chung, Neil C. Chi, Jessica E. Antosiewicz-Bourget, Igor Slukvin, Ron Stewart, Michael Q. Zhang, Wei Wang, James A. Thomson, Joseph R. Ecker, and Bing Ren (2013) Epigenomic Analysis of Multi-lineage Differentiation of Human Embryonic Stem Cells,Cell153:1134-1148).

23. Wei Xie, Cathy L Barr, Audrey Kim, Feng Yue, Ah Young Lee, James Eubanks, Emma L Dempster and Bing Ren (2012) Base-resolution analyses of sequence and parent-of-origin dependent 脱氧核糖核酸 methylation in the mouse genome,Cell148: 816-831.

24. Hao Wu, Volkan Coskun, Jifang Tao,Wei Xie, Weihong Ge, Kazuaki Yoshikawa, En Li, Yi Zhang and Yi Eve Sun (2010) Dnmt3a-Dependent Nonpromoter DNA Methylation Facilitates Transcription of Neurogenic Genes,Science329 (5990): 444-448.

25. Mark H. Chin, Mike J. Mason,Wei Xie, Stefano Volinia, Mike Singer, Cory Peterson, Gayane Ambartsumyan, Otaren Aimiuwu, Laura Richter, Jin Zhang, IVan Khvorostov, Vanessa Ott, Michael Grunstein, Neta Lavon, Nissim Benvenisty, Carlo M. Croce, Amander T. Clark, Tim Baxter, April D. Pyle, Mike A. Teitell, Matteo Pelegrini, Kathrin Plath and William E. Lowry (2009) Induced Pluripotent Stem Cells and Embryonic Stem Cells Are Distinguished by Gene Expression Signatures,Cell Stem Cell5(1): 111-123.

26. Wei Xie, Chunying Song, Nicolas L. Young, Adam Sperling, Feng Xu, Rupa Sridharan, Anne Conway, Benjamin A. Garcia, Kathrin Plath, Amander Clark and Michael Grunstein (2009) Histone H3 lysine 56 acetylation is linked to the core transcriptional network in human embryonic stem cells,Molecular Cell, 33(4):417-427.

27. Roberto 法拉利, Matteo Pellegrini, Gregory A. Horwitz,Wei Xie, Arnold J. Berk and Siavash K. Kurdistani (2008) Epigenetic reprogramming by adenovirus e1a,Science321, 1086-1088.

28. NimetMaherali*, RupaSridharan*,WeiXie, JochenUtikal, SarahEminli, KatrinArnold, MatthiasStadtfeld, RobinYachechko, JasonTchieu, RudolfJaenisch, KathrinPlath and KonradHochedlinger (2007) Directly reprogrammed fibroblasts showglobalepigeneticremodeling andwidespreadtissuecontribution,Cell Stem Cell, 1(1): 55-70.

29. Feng Xu, Qiongyi Zhang, Kangling Zhang,Wei Xieand Michael Grunstein (2007) Sir2 deacetylates histone H3 lysine 56 to regulate telomeric heterochromatin structure in yeast,Molecular Cell, 27(6): 890-900.