《史记探源》是一本由崔适（甫）撰写的图书，中华书局出版。该书以崔适的今文经学思想为核心，探讨了《史记》的历史背景和发展脉络。崔适在书中提出《史记》原属今文经学，司马迁时尚未有古文，后由刘歆据古文经学窜改，而杂有古文学。崔适的考辨旨在恢复《史记》原貌。

《史记探源》对史书典籍《史记》进行研究，作为近代经学家的作者从《史记》属“今文经学”为立足点，对著作进行仔细的校阅与辨正。《史记探源》主要内容包括序证、卷二 十二本纪、十表、三十世家、七十列傅等等。全书共八卷，除〈管蔡世家〉等十篇外，全部都有仔细深入之辨析。

崔适在《史记探源》中据今文经学观点，考证辨析所谓《史记》为刘所篡改者。他认为刘歆既伪造《左传》，则不得不波及《史记》以为佐证。此外，崔适还指出后世妄人所增及钞胥所脱，以及传钞过程中出现的衍、倒、改、解之误，并一一进行深入仔细之考辨，以“证其所本有，辨其所本无”（朱祖谋〈序〉）。崔适的目标是恢复《史记》的原貌。

崔适在《史记探源》中先为序证，论说贯串全书之问题，如春秋古文、尚书古文、书序、终始五德、十二分野等事。然后分本纪、十表、八书、三十世家、七十列传一一进行考辨。崔适认为《史记》中有二十九篇为后人所补和妄人所续，又说前人认定已亡佚的〈孝景本纪〉“实未亡耳”。尽管崔氏的论断中多有主观臆断之嫌，但他能以怀疑精神对《史记》全书进行深入考辨，对于中国古史的记述提出独到的分析，对于古史研究以及《史记》本身内容的认识，确有重要价值。

《史记探源》有清宣统二年崔氏觯庐初刻本、北京大学出版部排印本及中华书局点校本等版本。胡适开出的“一个最低限度的国学书目”，不收司马迁的《史记》，但有崔适的《史记探源》。