彩色棉花并非现代科技产物，早在美洲的印第安农民时期就已经有非白色的棉花品种。然而，当时的褐色棉花纤维过短，不适合工业化生产。直到
美国植物学家萨利·福克斯的努力，才使得彩色棉花得以商业化发展。她在1989年创立了天然棉花色彩公司，专门销售不同颜色的棉花，如红褐色的“小狼”棉、黄褐色的“野牛”棉和橄榄绿的“绿树”棉。这些棉花因其独特的特性——经过多次洗涤后颜色会加深，然后稳定下来，而不像传统的棉花那样褪色——而获得了农业专利，被称为“福克斯纤维”。
中国的彩棉育种研究始于1994年，目前已培育出多种颜色的彩棉，包括棕色、绿色、黄色、红色和紫色。中国农科院棉花研究所的棕絮1号和新疆天彩科技
Inc.的天彩棕色9801在国际上处于领先水平。此外，新疆
中国彩棉（集团）股份有限公司也拥有多个定型品种和优良选系材料，其中棕色、绿色、驼色三个品种已在新疆大规模种植并取得成功。
彩色棉花的独特之处在于其颜色稳定性，即使经过多次洗涤也不会明显褪色。这一特性使其在
纺织工业中具有显著优势，减少了对环境的危害。