海南省微生物学会成立于1980年7月，最初作为广东省海南省微生物学会而建立。随着海南建省，学会于1988年9月更名为海南省微生物学会。

初创时期

1980年7月，广东省海南行政区微生物学会正式成立。第一届理事会共有16人，其中包括胡光烈教授担任理事长，王世柏和林碧瑚讲师担任副理事长，以及潘祖安担任秘书长。学会初期挂靠在华南热带作物学院和华南热带作物研究院。

发展阶段

1985年10月，进行了换届选举，产生了第二届理事会，成员增至19人，代表会员人数达到150人。胡光烈继续担任理事长，王世柏、潘祖安和林碧瑚担任副理事长，潘祖安兼任秘书长。此时学会挂靠在海南省卫生防疫站。在这段时间内，学会活跃地开展了一系列活动，不仅在海口市举行，还扩展到了五指山市、乐东黎族自治县等地。此外，学会还邀请了来自中山医学院的袁卓雄教授和香港玛丽医院检验科微生物室主任前来讲学，取得了良好的反响。

升级转型

1988年4月海南建省后，同年9月，海南省微生物学会正式成立，并举行了首届会员代表大会。这次大会选举产生了新一届理事会，共15人，代表全省约180名会员。潘祖安当选为理事长兼秘书长，其他副理事长包括徐天惠、王翰龙、郑子龙等人。学会随后挂靠在海南省卫生防疫站。

继续发展

1991年10月，学会再次进行换届选举，产生了第二届理事会。徐天惠教授被选为理事长，张贵琛、王翰龙、郑子龙等成为副理事长，谢秀祯担任秘书长。学会在此时挂靠在海南师范大学，并吸纳了海口市力神咖啡厂作为团体会员。

新世纪变革

1995年8月，学会举行了第三次会员代表大会，选举产生了新的理事会。张贵琛担任理事长，谢秀祯、隶晓雄、李枚秋、郑子龙、王翰龙等担任副理事长，朱中元担任秘书长。学会挂靠在海南医学院附属新华医院，并同期举办了学术交流会。