中国农业科学院特产研究所建于1956年，是全国唯一的专门从事特种经济动植物资源保护、开发与利用的国家级综合性农业科研机构，也是中国农科院在吉林省的唯一直属单位，主要研究对象为珍贵、稀有、经济价值高的特种经济动植物。

1956年，吉林省特产试验站成立。

1957年，吉林省特产试验站定名为吉林省特产研究所。

1959年，毛皮动物研究部分归属中国农业科学院，成为中国农业科学院毛皮兽研究所。

1981年，中国农业科学院毛皮兽研究所定名为中国农业科学院特产研究所。

2011年11月27日，中国农业科学院特产研究所正式入驻长春市，位于长春市净月经济开发区。

据2018年8月特产研究所官网显示，特产所拥有在职职工504人，其中科技人员336人，高级职称68人，部级突出贡献专家10人，享受政府特殊津贴专家4人，吉林省高级专家3名，科技人员中具有博士学位19人，硕士学位90人。

享受政府特殊津贴专家：吴威、程世鹏、沈育杰、杨福合

吉林省高级专家：吴威、沈育杰、杨福合

据2018年8月特产研究所官网显示，特产所设有10个研究室，9个实验室，1个中国农业科学院经济动物疫病研究中心，1个吉林省重点实验室，1个吉林省工程技术研究中心，2个吉林省科技创新中心；成立了吉林中特生物技术有限公司、吉林特研药业有限公司、吉林中农特研饲料有限责任公司、中国农业科学院特产研究所参茸制品有限公司等4个独立核算企业，还建有农业部长白山生物资源野外科学观测实验站。

中国农业科学院研究中心：中国农业科学院经济动物疫病研究中心

吉林省重点实验室：吉林省中药现代化种植（养殖）技术重点实验室

吉林省工程技术研究中心：吉林省现代中药工程技术研究中心

吉林省科技创新中心：吉林省中花材及饮片加工转化科技创新中心、吉林省特种动物生物制品科技创新中心

院研究室：特种经济动物、野生经济动物预防兽医学、经济动物人兽共患病、药用植物、特作园艺、动物生物技术、观赏动、特产经济、产品加工、新药创制

院实验室：特种经济动物饲料与营养、繁殖技术、遗传育种，经济植物栽培、植保、植物营养，生物技术，特种经济动物病毒学、野生经济动物人兽共患病

据2018年8月特产研究所官网显示，特产所该所拥有各种大型仪器145台件；图书馆藏书3.6万余册。

据2018年8月特产研究所官网显示，特产所与新西兰、韩国、美国、加拿大、新加坡、澳大利亚、俄罗斯、朝鲜等国科研单位、大专院校建立了科技交流与合作。

据2018年8月特产研究所官网显示，特产所共承担各类研究项目490项，获得各类各级科研成果310项，获奖成果196项，70的科技成果已推广应用，共培训农民近二十万人次，科技贡献累计新增效益达2450多亿元。

2015年，特产研究所共获得国家自然科学基金资助9项，立项数量较去年增加80；其中，由温永俊博士主持申请的“狂犬病强毒株糖蛋白干预神经突触体第质释放循环功能的分子机制”获国家自然科学基金面上项目资助，支持资金63万元。其余8项为青年基金，共获156万元资助。

2013年，特产研究所张海华“西妥昔单抗对水貂毛囊发育调节机制研究”、郭利“自噬在牛病毒性腹泻病毒不同生物型感染宿主细胞中的作用及相关基因表达研究”、朱言柱“铝致大鼠肠粘膜免疫耐受消失的TLR9/NF-kB信号转导机制”3个项目喜获青年科学基金批准立项，经费总额70万元。

《特种经济动植物》设有毛皮动物、经济动物、特色鸟纲、专家答疑、疾病防治、花鸟虫鱼、信息荟萃、经济植物、药用植物、特色蔬菜、果树园地、产品加工、植物医院、供求信息等栏目。

《特产研究》（原名《特产科学实验》）主要栏目有研究报告、应用技术、测试分析、专论综述等；为国家科技部中国科技核心期刊、RCCSE中国核心学术期刊、《CAJ-CD规范》执行优秀期刊。

据2018年8月特产研究所官网显示，特产所设有4个二级学科博士学位授权点，5个二级学科硕士学位授权点。

二级学科博士学位授权点：特种经济动物饲养、预防兽医学、药用植物资源学、果树学

二级学科硕士学位授权点：野生动植物保护与利用、特种经济动物饲养、预防兽医学、药用植物资源学、果树学

据2018年8月特产研究所官网显示，特产所在读研究生62名。

• 精神文化

定位：立足产区、面向全国、服务“三农”

2021年9月26日，被认定为“2021年度农业农村信息化示范基地”。