聚合菌可构成陆生植物的丛枝菌根（arbuscular 聚合菌可构成陆生植物的丛枝菌根（arbuscular 在球囊菌-念珠藻共生关系中，还有一类功能不明、类似细菌的有机化合物（bacteria

球囊菌门（学名：Glomeromycota，AM fungi），又称聚合菌门、锈球菌门，是真菌界的七个门之一，目前约已发现400种生物。聚合菌可构成陆生植物的丛枝菌根（arbuscular mycorrhizas, AM），这种共生构造可协助植物吸收土壤中的无机盐，并据信是早期植物能适应陆地环境的重要关键。超过八成的维管植物都有由球囊菌构成的丛枝菌根，且在苔藓植物等没有真实根部构造的植物中亦有树状菌根，可见丛枝菌根在陆地生态系的重要性。

聚合菌可构成陆生植物的丛枝菌根（arbuscular mycorrhizas, AM），也因此被称为“AM Fungi”。许多证据显示在此共生关系中，聚合菌是绝对共生菌，须依赖植物合成的碳及能量才能生存，但有对某些物种的研究表明聚合菌可能可以单独存在。形成菌根的聚合菌广泛的分布在全世界的土壤中，和植物的根（或苔藓植物的假根）形成共生关系，它们也可以生存在盐度很高的沼泽中，和附生植物形成共生关系。

一种称为Geosiphon pyriformis的聚合菌（属于球囊霉目）和蓝菌门中念珠藻属的Nostoc punctiforme形成内共生关系，在此共生关系中，球囊菌形成多核的细胞，并将念珠藻属的蓝绿菌“吞入”。过去常以“Geosiphon pyrifome”称呼此内共生体，但现在这个名称只用来专指真菌，内共生体改以“Geosiphon symbiosis”称呼。聚合菌-念珠藻的共生关系是目前发现的唯一一种真菌和蓝绿菌的内共生关系，它不属于地衣，因为它们涉及细胞内的连结，且就结构与演化上的证据而言这种关系比较类似丛枝菌根。

在球囊菌-念珠藻共生关系中，还有一类功能不明、类似细菌的有机化合物（细菌界 like organisms），由于这类有机物出现在球囊菌门的各分枝物种中，而被认为可能在演化的早期就已和聚合菌形成共生关系，并进一步演变成内共生。

在整个系统中，念珠藻可独立生存，所以球囊菌是义务性共生者，不过聚合菌除了与念珠藻形成丛枝菌根外，也可与植物形成树状菌根，这个说法尚未获得证实，但已有若干证据支持。

球囊菌门的菌丝体是多核的，通常采用无性生殖，在菌丝的末端产生直径约80~500微米的孢子（称为Glomerospores）。在某些情况中，孢子生成后会进一步形成球囊状的构造（saccule）。