修饰基因通常表现为一种辅助角色，在某些情况下可以增强或削弱另一个基因的效果。它们可以在不同的条件下表现出各种各样的修饰作用。例如，在哺乳动物中，虽然存在决定毛色呈现黑色的主基因，但也已经发现了多个灰色、褐色或黄色等颜色淡化相关的隐性修饰基因群体。这些修饰基因似乎能够调节色素的数量，使得颜色变得更加浅淡。然而，当主基因决定了白色化时，无论何种修饰基因都不会显示出作用。此外，还有一些修饰基因能够通过抑制的方式干扰主基因的作用，如在鸡中发现的一种能够抑制色素形成的显性修饰基因。在这种情况下，修饰基因对主基因起到了上位关系的影响。
修饰基因的研究对于理解遗传学的基本原理以及
生物多样性的形成过程具有重要意义。通过对修饰基因及其相互作用的理解，科学家们能够更深入地探索基因之间的复杂关系，从而推动生命科学的发展。