中农发种业集团股份有限公司于1999年08月13日成立。法定代表人陈章瑞。

生产、加工、包装、批发、零售高粱种子、玉米种子；化肥、农药批发；花卉、蔬菜、水果的种植；销售食用农产品（不在北京地区开展上述的种植、生产、加工活动）；农业高新技术及产品的开发、技术转让、技术服务、技术推广；种子加工设备、检验仪器的销售、安装；进出口业务；货物仓储服务；对农业、食品业的投资、管理；与上述业务相关的信息资询服务。（市场主体依法自主选择经营项目，开展经营活动；依法须经批准的项目，经相关部门批准后依批准的内容开展经营活动；不得从事国家和本市产业政策禁止和限制类项目的经营活动。）

2023年7月6日，农发种业发布2023年半年度业绩预增公告，预计上半年实现归属于母公司所有者的净利润7100万元到7600万元，同比将增加51.58%到62.25%。

2023年7月27日，农发种业发布2023年半年度报告，上半年营业收入27.65亿元，同比增长13.53%；归属于母公司所有者的净利润7276.98万元，同比增长55.36%；基本每股收益0.0672元。

2020年12月，入选国资委公布的“双百企业”名单。

2021年1月30日，位列“2020中国上市公司品牌500强”榜单第250名。

2022年2月24日，中农发种业集团股份有限公司入选国务院国资委公布的“双百企业”名单。

2022年8月4日，中农发种业集团股份有限公司入选中华人民共和国农业农村部公布的国家农作物种业阵型企业名单。

2023年5月，入选国资委公布的“双百企业”名单。

2023年12月13日，《2023中国农业企业500强》排行榜发布，中农发种业集团股份有限公司排名第185位。