《数学荒岛历险记》根据李毓佩的《荒岛历险》改编，讲述数学小天才
罗克穿越到由数学博士Z统治的数学荒岛，并利用数学知识帮助大家的故事。
在数学岛上，有一个愿望之码。小岛上的事物与
地球截然不同，上面还生活着一群单纯快乐的居民和五只奇异的愿望兽--咔布。将“咔布”生产出的数字和“加减乘除”身上的符号正确填入其中，就可以实现任何愿望。性格各异的咔布们每三天就能实现主人一个小小的愿望，分别可以生产出古怪的鞋子、神奇的布料、美味的食物、结实的建筑材料以及神秘的数字。
统治这座小岛的是一位超级自恋，喜欢照镜子的国王。国王手下的四名士兵不仅各个身怀绝技，而且头上还有加减乘除四个数学符号，这些符号和咔布们生产出来的数字都与"愿望之码"息息相关。
Z博士一心想要得到五只咔布，想要统治世界。
罗克原本是个聪明又懒散，而且认为数学毫无实际意义的小男孩。他为了逃避无聊的数学竞赛，无意间来到了数学岛。自从一位神秘的巫师出现后，国王突然对孩子们的咔布产生了极大的兴趣，渴望要将它们占为己有。罗克和新朋友们为了保全咔布，利用数学和国王、Z博士斗智斗勇。
后Z博士还是拿到神秘的数字，数字后开始拼图许愿他统治数学，结果拼图变成了圆周率符号。国王正准备捉拿Z博士时，馆长来告诉国王，他查阅古籍发现数学岛出现了一百年一次的危机，数学岛的许多东西上面都有数字，数字一百年来都在变化，当数字变为零时，植物和房子甚至整个荒岛开始消失，只有愿望之码才可以化解危机，在大家谈论时，Z博士偷偷跑走，后
罗克去和博士抢夺愿望之码，在博士要掉到悬崖时，罗克救了Z
博士后，Z博士假意赞同罗克的话，去到熊洞后Z博士和罗克再次抢夺愿望之码的过程中愿望之门开启，罗克表示恢复数学岛，最终愿望之门答应并恢复了数学岛，Z博士回到了过去刚救国王的时候。
《数学荒岛历险记》的制作花费了5年的时间，经过多次修改和调整才制作出来。为了达到满意的效果，还专设了冬令营和夏令营，听取小朋友们的意见。《数学荒岛历险记》中的UBIQ机器人宠物是小朋友自己设计的。《数学荒岛历险记》改编自由
张景中院士的《帮你学数学》和
李毓佩教授的《荒岛历险》。