孔祥复（1942年9月4日—2019年6月17日），男，汉族，出生于四川重庆，原籍湖北阳新，无党派人士，分子生物学家，中国科学院院士，中国人民解放军陆军军医大学教授。

孔祥复1963年毕业于台湾中兴大学。1969年获美国范德堡大学博士学位。先后担任美国国立卫生研究院生化生理实验室主任，香港大学分子生物学研究所所长，陆军军医大学重庆西南医院病理研究所终身教授等职务。1999年当选为中国科学院院士。2004年至2010年，孔祥复任香港中文大学医学院首席教授。2019年6月17日因病逝世，享年76岁。

孔祥复长期从事功能基因组学、应用组学研究和人类基因治疗。共出版了专著15本，发表SCI论文500余篇。先后获NIH杰出实验室主任奖、NIH杰出成就奖、香港大学杰出研究成就奖等荣誉。其研究成果获国家科技进步一等奖、中华医学科技奖二等奖等奖项。

1942年9月4日出生于四川重庆，原籍湖北阳新。1949年孔样复随全家迁至台湾。1963年毕业于台湾中兴大学。1966年在国际刊物《生物化学杂志》上发表了第一篇论文。1969年获美国范德堡大学博士学位。

 1971年到1986年担任罗氏制药分子生物研究所（美国）生化部高级研究员，研究主任，参与到他人生中最重要的研究干扰素的开发工作中。1986年到1998年担任美国国立卫生研究院生化生理实验室主任。

1981年在全世界第一个研制出用于临床治疗的α-干扰素，获得发明专利并由美国食品卫生管理局（美国食品药品监督管理局）批准进入临床。1986年任美国国立卫生研究院生化生理实验室主任。1998年辞去了所有在美国的职务。

1999年回到中国，同年当选为中国科学院院士。1999年到2004年担任香港大学分子生物学研究所所长，首席教授。2004年到2010年担任香港中文大学医学院首席教授。2004年被天津市人民政府聘为特聘专家。

2010年11月被聘为陆军军医大学西南医院病理研究所终身教授、西南癌症中心名誉主任，博士生导师。

2017年，任中国人民解放军陆军军医大学教授。

2019年6月17日11时10分孔祥复因病医治无效在重庆逝世，享年76岁。

孔祥复研究了β-半乳糖酸的生物合成及调控机理，阐明Met-tRNA的修饰及转录终止因子及它们在细菌生物合成中的作用和机理；纯化了重组的人干扰素，结晶了第一个由重组得到的蛋白质—α干扰素，α干扰素已经是全球范围内公认治疗艾滋病、乙肝、丙型肝炎的关键药物；阐明了Ras基因和肿瘤的关系，发现Ras基因引起癌变需要磷脂酶C及神经生长因子对Ras信号的作用；以非洲蟾胚胎发育为系统，研究了骨形成蛋白（BMP-4）的信号转导途径，阐明了它们以及GATA基因对中胚层形成的影响，指出BMP-4具有抑制神经外胚层形成的作用；研究了多种来源於植物的抗病毒、抗肿瘤药物的结构、功能及性质，阐明了HCG制品抗HIV的作用机理，为抗HIV药物的研制提供了新思路。

孔祥复获国际专利19项，以下为部分专利。

孔祥复共发表SCI论文500余篇，以下为部分论文。

孔祥复共出版专著15本，以下为部分著作。

孔祥复为中国培养了一大批高层次人才，代表性学生有陆军军医大学病理学研究所副教授时雨，中山大学教授谢丹。

孔祥复的小儿子孔令宸这样评价父亲：“爸爸（孔祥复）觉得别人比自己更为重要。他总是助人为乐，家庭和朋友反而放在次要位置。这是他的成功之处。”

《重庆晨报》表示：“孔祥复在生命科学领域做出了杰出的贡献。”

重庆科协在《沙坪坝区领导慰问驻区科技工作者》一文中表示：“孔祥复是国际知名的分子生物学家，在国际学术界享有很高声誉和威望，在很多方面作出了关键性的贡献。”