在蛋白质分子中，从N-端到C-端的氨基酸排列顺序称为蛋白质的一级结构(primary structure)，通常是指蛋白质肽链的残基的排列顺序，也称为残基或氨基酸的序列。一级结构中的主要化学键是肽键，另外，蛋白质分子中所有二硫键的位置也属于一级结构范畴。

蛋白质的一级结构是一个无空间概念的一维结构，每一种蛋白质都有它特有的一级结构，一级结构相似的蛋白质具有相似的高级结构与功能。一级结构是蛋白质空间构想和特异生物学功能的基础，是蛋白质的基本骨架。

第一个被测定一级结构的蛋白质分子是牛胰岛素，于1953年由英国化学家Frederiek Sanger测定。测定蛋白质一级结构最常用的方法有Edman降解法、通过编码蛋白质的基因核苷酸序列推导蛋白质氨基酸序列和质谱法三种。

蛋白质一级结构可以直接进行蛋白质测序，或从脱氧核糖核酸序列推断。"一级结构"这一名词在Linderstrom-Lang于1951年的Lane Medical Lectures上首次被提到。

蛋白质一级结构(primary structure)

指蛋白质中共价连接的残基的排列顺序，包括二硫键的位置。

蛋白质的一级结构包括：

（1）组成蛋白质的多肽链的数目；

（2）多肽链的氨基酸顺序；

（3）多肽链内或链间二硫键的数目和位置。

1.测定多肽链的数目

2.拆分多肽链

3.断开多肽链内的二硫键

4.测定每一肽链的氨基酸组成

5.鉴定多肽链的N-末端和C-末端

6.裂解多肽链为较小的肽段

7.测定各肽段的氨基酸序列

8.利用重叠肽重建完整多肽链的一级结构

9.确定二硫键的位置