《使徒行者3》是《使徒行者》系列的第三部，也是
电视广播首次在流媒体平台优先播放的剧集，在香港TVB《万千星辉颁奖典礼2020》上，共获得19项提名。
薛家强（林饰）继续为刑事情报科执行任务，打击不同罪犯；而
卓凯（
苗侨伟饰）因三年前枪伤犯罪集团主脑的钱瑞安，而被判入狱三年。三年期满，卓凯出狱，但他的两名卧底已经下落不明。在刑满出狱后，
卓凯选择与妻子莫羡晴（
江美仪饰）开了家咖啡店安稳度日，却不料面临被黑帮追杀的危险。
另一方面，警方怀疑卓凯与金青社有关联，安排刑事情报科总督察
章纪孜（
黄智雯饰）调查他，于是，章纪孜与卓凯的前卧底
郑淑梅（
黄翠如饰）两人暗中着手调查卓凯与黑道人士的关系。
薛家强委派新人卧底朱倩混入模特儿公司，调查不同国籍少女在港失踪的案件。朱倩发现该公司诱拐少女作不道德交易，薛家强暗中通知警方准备营救行动后却不料遭遇伏击，朱倩更被人捉走。于是，薛家强找到
卓凯，并与卓凯一同侦查人口贩卖案件，最终和保安局首席调查员
韦作荣（
马国明饰）合力侦破。
保安局新设立的情报科邀请
徐天堂（
袁伟豪饰）加入，而卓凯则因人在江湖，被卷入黑帮话事人的选举。昔日的警队伙伴以另外一个身份去参加选举，在那里，卓凯重遇了原本已经被家强枪杀的老对手
覃欢喜（
许绍雄饰），并发现韦作荣的真正身份是昔日敌人
魏德信的亲弟魏德礼，他正计划对众人进行报复。
为了揭露韦作荣的真实身份，
卓凯需要冒着生命危险进行了深入调查。但保安局对韦作荣之前所犯的事情不予追究，还给他恢复了原职，这背后都有
香港特别行政区高官和富豪的影子。
韦作荣却不肯罢休，誓要置
卓凯、
薛家强、覃欢喜和
徐天堂于死地。于是，薛家强被内部调查科调查，卓凯遭高额悬赏，二人都落得亡命天涯。眼见
覃欢喜被人下毒，徐天堂扑了上去，终于让那人尝到了自己毒针的滋味。
此后，徐天堂和卓凯、薛家强只得藏身废楼。卓凯找到章纪孜，拿到了韦作荣的罪证并上传网络，没有了高层保护的韦作荣面临律政司再次指控，罪名更甚前次。惊恐的
韦作荣向黑道求助，却又因疑心病太重，打死了黑帮头目，成了黑白两道追寻的猎物。逃窜中的
韦作荣遇到了
薛家强，二人互射数枪后，韦作荣身亡。
韦作荣并未射中
薛家强要害，薛家强也恪守原则开枪只为制服罪犯。韦作荣头部致命一枪是来自外面的狙击手，到底还有谁想要韦作荣的命仍是个谜。
TVB曾邀请第一部电视剧版《
使徒行者》的“
丁小嘉”扮演者
佘诗曼，回归《使徒行者3》，但是佘诗曼一方因为档期原因冲突，所以拒绝了出演。
《使徒行者3》中，演员
郑恺在其中客串，扮演剧情一开始爆薛（
林峯）出场时与之对话的画家杀手，但这个画家杀手的脸部则完全被画板遮住。
2020年11月，演员
曾伟权因
肺癌去世，终年58岁，《使徒行者3》是他在荧幕上的最后一部作品。
2020年9月29日，《使徒行者3》放出首支预告片，宣布回归；10月9日，宣布定档10月12日，并发布主要角色定档海报；10月12日，发布“危机四伏”版终极预告及群像海报，官宣开播。
《使徒行者3》的剧情、演员阵容等方面，肯定要比之前口碑不佳的《
法证先锋4》要好得多。
林峯饰演的爆seed，
许绍雄饰演的
覃欢喜，依旧给人熟悉的感觉，而新加入的
马国明的银发造型则堪称亮眼。更值得一提的是，紧凑的剧情给人一种“自带2倍速”的错觉。总的来看，《使徒行者3》是近期
电视广播出品的电视剧中质量比较高的作品。（上游新闻·重庆晨报评）
这部剧，逻辑不在线。如果这是一部
偶像或者脑残剧，嘻嘻哈哈也就过去了。但是，这是一部刑侦剧。除了剧情刺激之外，逻辑与推理能力同样重要，合理的逻辑推动故事线的发展，而故事的推进又触发下一个逻辑。相比之前的《
使徒行者》剧版和影版，第三部悬疑度都太差了。演员没有故事和内心，都成为了剧情推动的纯工具人。而最让大家失望的，恐怕是《使徒行者3》逻辑有BUG，港味也是尽失。一句话，追下去并不难，但，不好味。（钱江晚报评）
《使徒行者3》有第一部的影子，可惜只是一点。一个明显的缺点可能是，《使徒行者3》的细节并不扎实。就拿核心的“卧底”元素来说，剧中的卧底、接头人、警员似乎都没有基本的保密工作意识，容易相信人，更容易轻易地暴露自己。不仅如此，或许是由于人物众多，《使徒行者3》也显得缺乏重点，多次出现情节不够感情戏来凑。同样受诟病的还有
庞浩洋与卧底阿兜的感情，一个是帮派坐馆候选人，一个是聪明机灵小女警，两人硬是将你来我往的暗战演成了满是粉红泡泡的偶像剧，蜜里调油的桥段让人甜得莫名其妙。（新闻晨报评）