赤溪发源于
建德市赤姑坪，流经多个地区后最终注入
衢江。在其流经过程中，经过了瑞溪、永昌、赤溪三个乡镇。赤溪的总落差达470米，河道比降为3.15‰。由于河道狭窄且弯曲，水流受到较大阻力。上游区域设有金山头、火炉山两座水库，统称为东风水库，这些水库的集雨面积达到50平方公里。
赤溪拥有四条主要的小支流，分别为下凌溪、下洪溪、胡思溪以及白沙溪。其中，下凌溪发源于瑞溪乡童店，流向南方，穿过沈岗到达永昌后汇入赤溪；下洪溪，也被称为何家溪，起源于诸葛镇的花坟头江，流经项村等地，最终在下洪溪村汇入赤溪；胡思溪源自登胜乡何尖岗，流经上汤等地点，最终在凤凰山附近汇入赤溪的新河道，这条新河道是在1972年至1977年间开挖完成的人工河道；白沙溪，又称桥头溪，源头位于汪高乡上新屋，向东流经白沙殿等多个村庄，最终在桥头汇入赤溪。