周永健自1962年起在中国农业科学院蔬菜花卉研究所工作，主持罇藏番茄育种课题，并参与了国家“六五”至“九五”期间的科技攻关课题研究。在番茄育种领域，他成功选育了
红玛瑙和红杂系列的罇藏番茄新品种十余个。1986年，周永健晋升为副研究员，1993年晋升为研究员。他还曾担任育种室主任，并担任北京市蔬菜学会副理事长。
周永健的研究成果获得了
全国科学大会、农业部、轻工业部及北京市政府的多项
科技成果奖。1992年，他被授予农业部有突出贡献中青年专家称号，并享受国家政府特殊津贴。
周永健在学术领域也颇有建树，参与编著了《中国农业百科全书蔬菜卷》《中国主要蔬菜抗病育种进展》《
农业大词典》等重要著作，并编著了《番茄优质高产栽培法》等论著。