1978年始建时为普通初级中学;1983年,
东至县委、县政府研究决定,成立“东至县高级职业中学”,设在东至县第三中学,实行“一校两制”的办学模式;1990年,东至县委、县政府决定将职业高中从东至县第三中学分离出去;1991年,安徽省教育委员会批准东至县第三中学增设高中部,成为普通完全中学;1994年升格为
池州市地区重点中学;1997年被评为“池州市示范高中”;2004年,经
安徽省教育厅批准,成为“
安徽省示范性普通高级中学”。
截至2016年12月,东至县第三中学现有58个教学班,在校学生3500名,教职工221名。专任教师中,高级教师116人,中级教师85人;学历合格率达100%,其中研究生30人。
2023年8月16日上午,由“
东至县大渡口中学”整合“东至三中高中部”更名的“东至县第三中学”在
大渡口镇揭牌,成为该镇史上首个省示范高中。
2023年8月16日上午,“
东至县大渡口中学”整合“东至三中高中部”更名为“东至县第三中学”。
2008年3月11日,中共池州市委、
池州市人民政府表彰了一批成绩突出的文明创建先进典型,被命名表彰为“池州市首届文明校园”。