海峡殖民地总督（Governor of the Straits Settlements），又称三洲府总督，是殖民地时期英国派驻海峡殖民地的英皇代表。早于1826年的时候，英国东印度公司将新加坡、槟城和马六甲三个辖地合并成海峡殖民地，并置海峡殖民地总督一职。至1858年，海峡殖民地转属于英属印度，至1867年复由英国殖民地办公室管理，并在同年独立为皇室殖民地。

在1867年起，海峡殖民地总督还同时管辖印度洋的圣诞岛和科科斯群岛，而且还同时兼任马来亚和文莱两地之高级专员。至1906年，沙巴州沙巴的纳闽港也划归海峡殖民地总督管辖。在第二次世界大战期间，除科科斯群岛外，海峡殖民地所有领土全为日军占领。至战后，海峡殖民地一度成立军政府，而海峡殖民地总督一职名义上继续存在，惟未几到1946年，海峡殖民地为英政府解散，总督之职遂随之废置。海峡殖民地总督废置后，新加坡置星洲总督一职，并成为独立的皇室殖民地，同时管辖科科斯群岛和圣诞岛。而槟城与马六甲则与马来亚联盟的九个州合组为马来联邦，纳闽则划归英属沙巴州。