苏州大学生化工程研究所成立于1993年，前身是苏州医学院保健食品研究所。自成立以来，在科学研究和科技开发领域开展了广泛的工作，并取得了显著成就。现任所长为
吴士良教授。
在科学研究方面，该所在糖基化与肿瘤相关性研究、β放射性烧伤研究等领域拥有国内领先的学术地位。此外，研究所还专注于中药多糖与海洋药物多糖机理的深入研究，旨在推动中药多糖在全球范围内的发展。
在科技开发应用研究方面，研究所对氨基酸的应用、胶原系列的研究以及蜂产品的相关研究均有显著贡献。目前，研究所正在积极寻求与企业的产学研合作，以促进研究成果的实际转化。
苏州大学生化工程研究所近年来共承担了包括国家自然科学基金课题在内的多个国家级和省级科研项目，并获得了十多项科研成果与奖励。同时，发表科研论文近一百篇，其中包括二十多篇被SCI收录的文章。