舟山师范专科学校前身为浙江师范学院舟山分校。1977年下半年在舟山师范学校基础上筹建，1978年4月14日，省革命委员会〔浙革（1978）47号文件〕批准建立浙江师范学院舟山分校，其时与舟山师范学校合办，同一套机构与领导班子。1981年7月，浙江师范学院舟山分校与舟山师范学校体制分设，人员分别编制。1983年12月，
浙江省人民政府批准浙江师范学院舟山分校改为舟山师范专科学校，同时将舟山地区教师进修学院并入舟山师专，设为进修部。学校实行“省市共管，以市为主”的管理体制。1988年7月，学校迁往定海文化路新址办学。1998年3月，正式与原
浙江海洋大学联合办学。