《高斯奥特曼VS杰斯提斯奥特曼》是一部由北浦嗣巳执导的科幻电影，于2003年8月2日上映。影片讲述了高斯奥特曼和杰斯提斯奥特曼之间为保护或毁灭地球而展开的一系列故事。另外，该电影还有一部续集《高斯奥特曼VS杰斯提斯奥特曼最终决战》，同样由北浦嗣巳执导，杉浦太阳、铃木茧果、吹石一惠等参与演出。

一天，宇宙开发中心的上空发现了来历不明的航天飞机（葛洛卡母舰），一名神秘女子（藤原树里，杰斯提斯奥特曼。）出现，继而受到一台葛洛卡·卒的袭击。高斯奥特曼及时出现并打败一台葛洛卡卒，后葛洛卡卒又出现了两台，高斯陷入危机，武藏和高斯合体，高斯变成日食形态，发出暂停射击停止了两台葛洛卡卒，但是另一个奥特曼杰斯提斯忽然出现，他再次启动了两台葛洛卡卒并且和他们联手击败了高斯，摧毁了宇宙运送火箭高斯诺亚。太空船的目的到底是什么？

原来，神秘女子来地球竟不是为了维持宇宙的秩序，而是要把地球上所有生物全部消灭！为了自救，世界各国想尽所有办法，但似乎，高斯的死是被提前判了死刑。地球即将毁于一旦，大家没有一点办法，除非奇迹出现…然而，武藏的亲人和队友都坚信高斯和武藏未死，他们四处奔走，希望奇迹真的出现！