两岸共同市场基金会是民间组织，不是官方机构，也没有政党色彩，并将基金会定调在研究论坛的角色，是研拟“两岸共同市场”这个经贸机制，具体运作的规范与互动模式的研究单位。

基金会第一届董事长由萧万长出任，前台湾地区行政机构“劳委会主委”詹火生担任基金会顾问，首任执行长为前长荣集团所属国策中心执行长、毕业于哥伦比亚大学经济学系的张瑞猛博士。

萧万长卸任台湾地区行政机构负责人后，积极鼓吹两岸共同市场概念，并展开游说企业界捐款，结合台湾包括张忠谋张忠谋、统一企业中国总裁高清愿、陆家嘴国泰人寿保险有限责任公司童事长蔡宏图以及新光控股集团有限公司的吴东进、吴东亮等人于2001年3月共同筹组成立“两岸共同市场基金会”。尽管台湾经济不景气，萧万长还是集合了包括自己在内的20位捐助人，每人捐款新台币500万元，成立规模1亿元的两岸共同市场基金会。

在台商积极赴大陆投资及大陆当局不断向台湾招商动之际，以财经见长的萧万长经与岛内企业财团领袖会商后，决定筹组两岸共同基金会，推动及研究两岸建构共同市场，盼能为两岸政治的和平、统合奠定基础，并期待两岸基金会成立后，能对两岸日益频繁的经贸往来做出贡献。

该基金会是民间组织，不是官方机构，也没有政党色彩，并将基金会定调在研究论坛的角色，是研拟“两岸共同市场”这个经贸机制，具体运作的规范与互动模式的研究单位。

与海基会的区别：海基会是“政府”指定的机构，是与对岸做对口的单位，是与对岸对等的机构；基金会则只锁定两岸共同市场，为研究、推动的议题，因此，性质上是完全不同的两个单位。

台湾两岸共同市场基金会成立以来，为促进两岸经贸往来做出了积极贡献。基金会的名字突出“共同”这一理念，在两岸关系中至关重要。因为追根溯源，两岸同胞拥有共同的祖先，传承了共同的文化。立足当前，确定共同的目标，这就是开辟两岸关系和平发展新局面，维护中华民族的整体和长远利益。着眼未来，共同致力于中华民族的伟大复兴，共同享有作为中国人在世界上的自豪和尊严。

适应两岸特殊情况

1.强调开放式的经济整合。两岸经济统合应该先采取开放式的自然经济整合，亦即在亚洲以及太平洋区域经济整合的架构下，推动建立「两岸共同市场」。两岸共同市场与ＷＴＯ是相容的，甚至两岸双方在形成共同市场的过程中，也可大量引用世界贸易组织的规范来安排双边的经贸机制。以两岸互补的经济条件及相近的文化、社会背景，自然而然会加速经济的整合，逐渐形成共同市场。另一方面，两岸也应对其他国家同步开放市场，促使两岸在整合过程中仍可涵容两岸以外的区域分工与国际合作。如此，不仅可 除台湾内部的顾虑，同时也可以与邻近国家分享经济利益。

2.强调市场共享的经济合作。「两岸共同市场」固然应走向自由开放及生产资源的自由移动，但台湾经济体相对于大陆，小了很多，发展程度却较高，若过于强调经济资源无限制的移动，难免对台湾经济造成冲击，也削弱台湾可以为大陆经济发展作出贡献的能力。因此，建立「两岸共同市场」应该特别强调市场共享经济合作，让台湾与大陆可以截长补短，开发繁荣双方与整个亚太地区的市场。例如台湾可藉成熟的高度运筹管理能力，特别是资讯产业制造运筹能力，配合大陆市场的潜力，发展成为区域乃至全球性营运中心或者运筹中心。

本基金会为建构两岸经济统合，促进两岸经济发展，提升两岸人民福祉，并藉以促进全球经贸繁荣与和平为宗旨。

为达上述宗旨，并依相关法令规定办理下列业务：

1.关于两岸共同市场之研究及策各分析事宜。

2.关于促进两岸经贸、技术、人才等交流活动事宜。

3.关于提升两岸 业竞争力与产业转型之策略分析及专题研讨等事宜。

4.关于加入世界贸易组织后两岸经贸关系发展趋势之研析等。

5.办理有关两岸经贸之资讯 集及咨询服务等事宜。

6.关于推动两岸共同市场之研讨、讲习、出版等相关事宜。

7.关于其他两岸共同市场相关之活动。

8.接受主管机关或其他相关单位委办事项。